RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	SNZ2	P53824	298 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	TEP1	P53916	434 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SFB2	P53953	876 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YNL034W	P53963	612 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YNL018C	P53976	612 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SDH1	Q00711	640 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	ERV41	Q04651	352 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	TRE1	Q08919	783 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YLR053C	Q12026	108 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	TRM11	Q12463	433 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	AAD3	P25612	363 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	STE13	P33894	931 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	AGP2	P38090	596 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	APN2	P38207	520 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	HSM3	P38348	480 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	RFC3	P38629	340 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YIL054W	P40524	105 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	NIT3	P49954	291 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	HOP2	P53187	214 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SND1	Q04007	877 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	ARO80	Q04052	950 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YDR514C	Q04408	483 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	CDD1	Q06549	142 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	RSC58	Q07979	502 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	AIM39	Q08223	395 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	VHS3	Q08438	674 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	GUP2	Q08929	609 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YPR027C	Q12079	277 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YPT6	Q99260	215 aa		5	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SRB2	P34162	210 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SET3	P36124	751 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	ETR1	P38071	380 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	CCZ1	P38273	704 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	FZO1	P38297	855 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SWC5	P38326	303 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YAP1801	P38856	637 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	REV7	P38927	245 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YDR089W	P38966	869 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	AVT2	P39981	480 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	IES5	P40060	125 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YIL089W	P40500	205 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	AXL1	P40851	1208 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	TAH11	P47112	604 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	ILM1	P47155	203 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	ECL1	P48235	211 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	TAF6	P53040	516 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	MND1	P53102	219 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	INA17	Q02888	182 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YET3	Q07451	203 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	CHS1	P08004	1131 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	WHI2	P12611	486 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	PUT4	P15380	627 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	COY1	P34237	679 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	FUI1	P38196	639 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YHL012W	P38709	493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SCC4	P40090	624 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	MAF1	P41910	395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SAE2	P46946	345 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	AIM14	P53109	570 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	BET4	Q00618	327 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YMR160W	Q03823	816 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	NHX1	Q04121	633 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	XYL2	Q07993	356 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	HFI1	Q12060	488 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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