RNA–Protein interactions for RNA: YMR172W

HOT1, Transcript of Transcription factor for glycerol biosynthetic genes, yeast

Gene HOT1, Length 2,160 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HOT1	YMR172W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	USE1	P53146	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	CUL3	P53202	744 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	LSB1	P53281	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	ARL3	Q02804	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	SWF1	Q04629	336 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	PHO8	P11491	566 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	RGP1	P16664	663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	SPO11	P23179	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	SEC61	P32915	480 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	ELF1	P36053	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	DUG2	P38149	878 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	SPC97	P38863	823 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	PKP1	P40530	394 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	YNR068C	P53754	272 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	PNP1	Q05788	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	BUR2	Q05949	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	PDR8	Q06149	701 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	AKR2	Q12013	749 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	PUS9	Q12069	462 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	HER1	Q12276	1246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	CHS2	P14180	963 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	CDC23	P16522	626 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	RAM1	P22007	431 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	YSP3	P25036	478 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	SNT1	P25357	1226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	DMC1	P25453	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	IRE1	P32361	1115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	SKG1	P36169	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	PCA1	P38360	1216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	GOS1	P38736	223 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	PAN5	P38787	379 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	ATG32	P40458	529 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	ROG3	P43602	733 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
HOT1	YMR172W	SAE2	P46946	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	IDS2	P46958	469 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	RPE1	P46969	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	NNF1	P47149	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	YGR237C	P50089	785 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	TAF4	P50105	388 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	FMP48	P53233	369 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	UME1	Q03010	460 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	RUB1	Q03919	77 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	SEG1	Q04279	960 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	GRS2	Q06817	618 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	YEH1	Q07804	573 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	FRE5	Q08908	694 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	PSF3	Q12146	194 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	RRI2	Q12348	645 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	DGK1	Q12382	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	PHO5	P00635	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	INH1	P01097	85 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	SCEI	P03882	235 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	CLN3	P13365	580 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	PUT4	P15380	627 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	NPP1	P25353	742 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	HXT1	P32465	570 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	PET127	P32606	800 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	MRP4	P32902	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	RAD55	P38953	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	SEO1	P39709	593 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	PSY2	P40164	858 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	GTO1	P48239	356 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	PIP2	P52960	996 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HOT1	YMR172W	ASI2	P53895	289 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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