RNA–Protein interactions for RNA: YMR065W

KAR5, Transcript of Protein required for nuclear membrane fusion during karyogamy, yeast

Gene KAR5, Length 1,515 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR5	YMR065W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	UBP13	P38187	747 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	YER010C	P40011	234 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	PIG1	Q06216	648 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	PCI8	P40512	444 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	SNM1	P40993	198 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	VPS4	P52917	437 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	RSM28	Q03430	361 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	ATX2	Q12067	313 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	HER1	Q12276	1246 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	MGM1	P32266	881 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	SWP82	P43554	623 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	YAP7	Q08182	245 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	NBP2	Q12163	236 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	VCX1	Q99385	411 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	TMT1	P32643	299 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	VPS25	P47142	202 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	YPT11	P48559	417 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	PFA5	Q03289	374 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	SWF1	Q04629	336 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	SSP2	Q08646	371 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	PET111	P08468	800 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	GPA1	P08539	472 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	SSH4	P32343	579 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	PSD1	P39006	500 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	CBK1	P53894	756 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	SNO4	Q04902	237 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	GEP3	Q08622	556 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	FRE3	Q08905	711 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	HSP32	Q08992	237 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	ASK1	P35734	292 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	AXL2	P38928	823 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	VPS41	P38959	992 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	CTK2	P46962	323 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	RCO1	Q04779	684 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	ECM10	P39987	644 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	YIR016W	P40572	265 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	IME4	P41833	600 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	MPS1	P54199	764 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	RAP1	P11938	827 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	MRP20	P32387	263 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	CBF2	P32504	956 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	PXL1	P36166	706 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	ESL2	P36168	1195 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	MDV1	P47025	714 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	MUB1	Q03162	620 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	POS5	Q06892	414 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR5	YMR065W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	OPY2	Q06810	360 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
KAR5	YMR065W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	CHO1	P08456	276 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	YNR061C	P53747	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	BOP3	P53958	396 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	GSH2	Q08220	491 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	UBX3	Q12229	455 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	STE50	P25344	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	ALY1	P36117	915 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	SLZ1	P40167	298 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	YJR061W	P40355	935 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	YFR020W	P43600	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	SKM1	Q12469	655 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	VRG4	P40107	337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	NNF2	P53253	936 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	BSC5	P53755	489 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KAR5	YMR065W	CAC2	Q04199	468 aa		4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.1 ms