RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	MRX1	P40050	688 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR224W	YLR224W	IML2	P47031	731 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR224W	YLR224W	BNA1	P47096	177 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR224W	YLR224W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YLR224W	YLR224W	VID22	Q05934	901 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR224W	YLR224W	PIG1	Q06216	648 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR224W	YLR224W	CRN1	Q06440	651 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR224W	YLR224W	YLR049C	Q12110	428 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR224W	YLR224W	VCX1	Q99385	411 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YLR224W	YLR224W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	GPA1	P08539	472 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	SRB5	P32585	307 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	SCO2	P38072	301 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	RIC1	P40395	1056 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	YPT11	P48559	417 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	UBP8	P50102	471 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	FCP1	Q03254	732 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	SWF1	Q04629	336 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	YLR455W	Q06188	304 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	YLR302C	O13544	120 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	YCR006C	P25350	157 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	CDC15	P27636	974 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	MGM1	P32266	881 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	SLC1	P33333	303 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	UBP13	P38187	747 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	SWP82	P43554	623 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	VPS4	P52917	437 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	REG1	Q00816	1014 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	TRM8	Q12009	286 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	ATX2	Q12067	313 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	ERG8	P24521	451 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	VPS41	P38959	992 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	ECM10	P39987	644 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	YIR016W	P40572	265 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	CTK2	P46962	323 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	MDV1	P47025	714 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	VPS25	P47142	202 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	YML131W	Q03102	365 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	CAC2	Q04199	468 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	RCO1	Q04779	684 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	RAP1	P11938	827 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	STE50	P25344	346 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	YER010C	P40011	234 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	PFA5	Q03289	374 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	RSM28	Q03430	361 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	PSK2	Q08217	1101 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	NUS1	Q12063	375 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	NBP2	Q12163	236 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.12	□□□□□ -1.91	RIP-Chip
YLR224W	YLR224W	PET111	P08468	800 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	MRP20	P32387	263 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	CBF2	P32504	956 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	ATO2	P32907	282 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	AXL2	P38928	823 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	PSD1	P39006	500 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	GSH2	Q08220	491 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	SSP2	Q08646	371 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	DSE3	Q08729	430 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	FRE3	Q08905	711 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	UBX3	Q12229	455 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	YOR019W	Q99248	730 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	RRN3	P36070	627 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	IME4	P41833	600 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	YNR061C	P53747	219 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	BOP3	P53958	396 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	CHO1	P08456	276 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	CLB2	P24869	491 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	RER1	P25560	188 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	ESL2	P36168	1195 aa		3.09	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.5 ms