RNA–Protein interactions for RNA: YHR067W

HTD2, Transcript of Mitochondrial 3-hydroxyacyl-thioester dehydratase, yeast

Gene HTD2, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HTD2	YHR067W	YNR061C	P53747	219 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTD2	YHR067W	SNO4	Q04902	237 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTD2	YHR067W	PIG1	Q06216	648 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTD2	YHR067W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HTD2	YHR067W	HSP32	Q08992	237 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTD2	YHR067W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	MRX1	P40050	688 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	HER1	Q12276	1246 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	RGT2	Q12300	763 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	YPR089W	O13585	888 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	PET111	P08468	800 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	PXL1	P36166	706 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	VPS41	P38959	992 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	GAT1	P43574	510 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	YNL144C	P53907	740 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	RSM28	Q03430	361 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	GEP3	Q08622	556 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	FRE3	Q08905	711 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	NUS1	Q12063	375 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	CHO1	P08456	276 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	RER1	P25560	188 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	SSH4	P32343	579 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	MRP20	P32387	263 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	CBF2	P32504	956 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	SCO2	P38072	301 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	ECM10	P39987	644 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	PCI8	P40512	444 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	YPT11	P48559	417 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	CBK1	P53894	756 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	VTC3	Q02725	835 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	PFA5	Q03289	374 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	RCO1	Q04779	684 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	ICT1	Q12385	394 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	CDC15	P27636	974 aa		4.18	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	TMT1	P32643	299 aa		4.18	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	FMP10	P40098	244 aa		4.18	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	IME4	P41833	600 aa		4.18	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	CTK2	P46962	323 aa		4.18	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	UBP8	P50102	471 aa		4.18	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	MGM1	P32266	881 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	ASK1	P35734	292 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	ALY1	P36117	915 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	SPC97	P38863	823 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	YFR020W	P43600	232 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	SWF1	Q04629	336 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	ATX2	Q12067	313 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	STE50	P25344	346 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	ESL2	P36168	1195 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	YJR061W	P40355	935 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	MEP3	P53390	489 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	ASI1	P54074	624 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	SEC5	P89102	971 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	MUB1	Q03162	620 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	OPY2	Q06810	360 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	YAP7	Q08182	245 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	NBP2	Q12163	236 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HTD2	YHR067W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	RAP1	P11938	827 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	MCM10	P32354	571 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	SLZ1	P40167	298 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	YIR016W	P40572	265 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	VPS25	P47142	202 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	CAC2	Q04199	468 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
HTD2	YHR067W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	VID27	P40157	782 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	SNM1	P40993	198 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	SIP4	P46954	829 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	MDV1	P47025	714 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	INN1	P53901	409 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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