RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	ZIM17	P42844	174 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	SPG5	P42933	373 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	HXT16	P47185	567 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	PMT3	P47190	753 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	SPC105	P53148	917 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	TEP1	P53916	434 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	ESBP6	P53918	673 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	VAC7	P53950	1165 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	HXT15	P54854	567 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	CTR9	P89105	1077 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	TRS23	Q03784	219 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	ARG7	Q04728	441 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	DIC1	Q06143	298 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YOL024W	Q08172	172 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YPL272C	Q08984	517 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	MPH2	P0CD99	609 aa		5.86	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	KAR3	P17119	729 aa		5.86	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	SPR1	P32603	445 aa		5.86	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	ELM1	P32801	640 aa		5.86	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	SEA4	P38164	1038 aa		5.86	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	QDR1	P40475	563 aa		5.86	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	CIR2	Q08822	631 aa		5.86	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	VPS68	Q12016	184 aa		5.86	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	AFI1	Q99222	893 aa		5.86	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YOR338W	Q99326	363 aa		5.86	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	RPC25	P35718	212 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	CCT6	P39079	546 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YEL028W	P39989	153 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YIL054W	P40524	105 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	MMM1	P41800	426 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	BIR1	P47134	954 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YGL260W	P53056	76 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	PCL10	P53124	433 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	BET4	Q00618	327 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	RKM2	Q03942	479 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	HRQ1	Q05549	1077 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	VID22	Q05934	901 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	THI21	Q08975	551 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	TRM8	Q12009	286 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YPR089W	O13585	888 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	MRC1	P25588	1096 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	TAF14	P35189	244 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	EXO5	P38289	585 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	MSR1	P38714	643 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	TIM17	P39515	158 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	SIP4	P46954	829 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YPT11	P48559	417 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	SWC4	P53201	476 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	RTS3	P53289	263 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YNL143C	P53908	130 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	TGL2	P54857	326 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	SIZ1	Q04195	904 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	SWC7	Q06707	132 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	TMS1	Q12116	473 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YDR262W	Q12331	272 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	SPC110	P32380	944 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	SEF1	P34228	1148 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	ARA1	P38115	344 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	YHL041W	P38730	149 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	TDA3	P38758	523 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	YER130C	P39959	443 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	PLB3	Q08108	686 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	YIG1	Q08956	461 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	YLL054C	Q12244	843 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	NSI1	Q12457	570 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	GPA1	P08539	472 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	GAL11	P19659	1081 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	NPR1	P22211	790 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	YCR006C	P25350	157 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	SWC5	P38326	303 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	MGS1	P40151	587 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	YJL132W	P47014	750 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	IKS1	P47042	667 aa		5.82	□□□□□ -1.48

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