RNA–Protein interactions for RNA: YFL037W

TUB2, Transcript of Beta-tubulin, yeast

Gene TUB2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TUB2	YFL037W	YPR089W	O13585	888 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	ABF1	P14164	731 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	STE4	P18851	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	NDI1	P32340	513 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	SPR1	P32603	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	PHO11	P35842	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	PHO12	P38693	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	CYC2	P38909	366 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	RGA1	P39083	1007 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	YAL037W	P39728	267 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	YMR134W	P40207	237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	BIR1	P47134	954 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	YPR003C	P53394	754 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	CCE1	Q03702	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	EMI1	Q04406	187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	BUD7	Q08754	746 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	TRM8	Q12009	286 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	SKM1	Q12469	655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	SEM1	O94742	89 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	QCR6	P00127	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	VAN1	P23642	535 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	MSH1	P25846	959 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	CWP1	P28319	239 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	SRP101	P32916	621 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	CNS1	P33313	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	GMH1	P36125	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	PIM1	P36775	1133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	YBP1	P38315	674 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	DBP8	P38719	431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	ADY3	Q07732	790 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	DAL82	P21705	255 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	TSR4	P25040	408 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	PEX5	P35056	612 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	STB6	P36085	766 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	UBS1	P38290	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	SMF2	P38778	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	PCL5	P38794	229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	SEC9	P40357	651 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	IRR1	P40541	1150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	ZIM17	P42844	174 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	RTS3	P53289	263 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	VAC14	Q06708	880 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	SUL2	Q12325	893 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	LDB17	Q12342	491 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	RIP1	P08067	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	LDB7	P38210	180 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	MMS21	P38632	267 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	SMF1	P38925	575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	CAJ1	P39101	391 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	TIM17	P39515	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	CEM1	P39525	442 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	ALG8	P40351	577 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	GTS1	P40956	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	IME4	P41833	600 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	PXA1	P41909	870 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	SSU1	P41930	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	ERR3	P42222	437 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	OSW7	P43611	510 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	RPC17	P47076	161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	FRE4	P53746	719 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	TRS31	Q03337	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	BLS1	Q06071	122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	NUT2	Q06213	157 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	AIM41	Q12032	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	ISU2	Q12056	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	GTT2	Q12390	233 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TUB2	YFL037W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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