RNA–Protein interactions for RNA: YBL053W

YBL053W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YBL053W, Length 375 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBL053W	YBL053W	IRC5	P43610	853 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	SHY1	P53266	389 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	RRN11	Q04712	507 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	CRF1	Q04930	467 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	HNT3	Q08702	217 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	YRM1	Q12340	786 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.96	□□□□□ -2.26	not detected
YBL053W	YBL053W	YOL098C	Q12496	1037 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	PRB1	P09232	635 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	SPC110	P32380	944 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	NDC1	P32500	655 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	RPR2	P40571	144 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	YJR096W	P47137	282 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	MNT2	P53059	558 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	SGF73	P53165	657 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	ATG21	Q02887	496 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	TAF7	Q05021	590 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	TRI1	Q05024	226 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	MRC1	P25588	1096 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	YIM1	P28625	365 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	THI4	P32318	326 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	VFA1	P40080	203 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	NUP82	P40368	713 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	HLJ1	P48353	224 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	CIA1	Q05583	330 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	COX1	P00401	534 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	ATR1	P13090	542 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	YBL059W	P34224	193 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	STB5	P38699	743 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	YDR109C	Q04585	715 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	GTB1	Q04924	702 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	NTG2	Q08214	380 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	YOR387C	Q08910	206 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	HRT3	Q12347	344 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	URA3	P03962	267 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	STV1	P37296	890 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	PHO90	P39535	881 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	EMP65	P40085	556 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	DJP1	P40564	432 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	MSY1	P48527	492 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	ARK1	P53974	638 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	CDC45	Q08032	650 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	YOR378W	Q08902	515 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	EDE1	P34216	1381 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	GAC1	P28006	793 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	HXT9	P40885	567 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	TRS31	Q03337	283 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	YPS3	Q12303	508 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	CLB2	P24869	491 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	NAM9	P27929	486 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	PTR2	P32901	601 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	PHD1	P36093	366 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	BUD6	P41697	788 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	YNR071C	P53757	342 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	TSA2	Q04120	196 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	AYT1	Q12226	474 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	RER1	P25560	188 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	TUL1	P36096	758 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	NDT80	P38830	627 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	NNF1	P47149	201 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	NUP100	Q02629	959 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	TFB2	Q02939	513 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	MSS11	Q03825	758 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	VPS64	Q03944	604 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	ATG23	Q06671	453 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	VAM6	Q07468	1049 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	ERV2	Q12284	196 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	ACH1	P32316	526 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	TAF5	P38129	798 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	YER130C	P39959	443 aa		0.88	□□□□□ -2.27

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