RNA–Protein interactions for RNA: YNL108C

YNL108C, Transcript of Protein phosphatase, yeast

Gene YNL108C, Length 813 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL108C	YNL108C	UGA2	P38067	497 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	YRO2	P38079	344 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	RGD1	P38339	666 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	YHR054C	P38780	354 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	WSS1	P38838	269 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	DUN1	P39009	513 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	CHS6	P40955	746 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.75	□□□□□ -1.49	not detected
YNL108C	YNL108C	MIG2	P53035	382 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	RNT1	Q02555	471 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	URC2	Q04411	772 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	YLR173W	Q06247	608 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	TFC6	Q06339	672 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	SWT1	Q12104	458 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	PSF3	Q12146	194 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	TY3A-G	Q12173	290 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	TY3A-I	Q99219	290 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	YPK2	P18961	677 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	RNQ1	P25367	405 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	GEX1	P25596	615 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	CTF13	P35203	478 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	UBP13	P38187	747 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	YBL029W	P38201	376 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	SMF2	P38778	549 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	SCC4	P40090	624 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	PUG1	P40100	303 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	YIL092W	P40497	633 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	YHM2	Q04013	314 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	FUS2	Q05670	677 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	SEC10	Q06245	871 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	YIG1	Q08956	461 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	GPM3	Q12326	303 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	AVL9	Q12500	764 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	PHO5	P00635	467 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	APE1	P14904	514 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	UGA4	P32837	571 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	LYS9	P38999	446 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	MBP1	P39678	833 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	YJR061W	P40355	935 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	LYS14	P40971	790 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	YGL176C	P46945	554 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	SIP4	P46954	829 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	LOH1	P47055	219 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	PIB2	P53191	635 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	GIM5	Q04493	163 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	SNO4	Q04902	237 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	RTT103	Q05543	409 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	GRS2	Q06817	618 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	TCO89	Q08921	799 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	HSP32	Q08992	237 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	NUR1	Q12066	484 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	PUS9	Q12069	462 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	DCS2	Q12123	353 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	PET18	P25362	215 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	PEP3	P27801	918 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	OAF3	P36023	863 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	YBR284W	P38150	797 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	SMF1	P38925	575 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	HXT7	P39004	570 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	IAH1	P41734	238 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	GLG2	P47011	380 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	YDR514C	Q04408	483 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	MRPL1	Q04599	285 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	YDR306C	Q06640	478 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	DSE3	Q08729	430 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	RIM20	Q12033	661 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL108C	YNL108C	ULA1	Q12059	462 aa		5.72	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.7 ms