RNA–Protein interactions for RNA: YMR158W

MRPS8, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRPS8, Length 468 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS8	YMR158W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
MRPS8	YMR158W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	YIR016W	P40572	265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	MDV1	P47025	714 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	SCS3	P53012	380 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	YNL144C	P53907	740 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	ATX2	Q12067	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	PHO81	P17442	1178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	YSP3	P25036	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	OCT1	P35999	772 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	PXL1	P36166	706 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	ATO2	P32907	282 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	DJP1	P40564	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	MCH4	Q08268	501 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	BAG7	Q12128	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS8	YMR158W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	EXO84	P38261	753 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	VPS41	P38959	992 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	PHM8	P40025	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	CIA1	Q05583	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	PIG1	Q06216	648 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	ATG23	Q06671	453 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	SNA4	Q07549	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	GPA1	P08539	472 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	YCR006C	P25350	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	GEX2	P36173	615 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	ACA1	P39970	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	SWT1	Q12104	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	YIL152W	P40455	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	UBX4	P54730	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	DSE3	Q08729	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	UBX3	Q12229	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	MSM1	P22438	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	YCL049C	P25577	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	ASG1	P40467	964 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	SWA2	Q06677	668 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	GSH2	Q08220	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	FRE3	Q08905	711 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	YUR1	P26725	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	UBP13	P38187	747 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	PSF2	P40359	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	BOP3	P53958	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	MLH2	Q07980	695 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	SRL1	Q08673	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	COX17	Q12287	69 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	PCD1	Q12524	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	MEP2	P41948	499 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	VPS25	P47142	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	NUP53	Q03790	475 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	BUD7	Q08754	746 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	YCR043C	P25361	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	NUP120	P35729	1037 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	UBP8	P50102	471 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPS8	YMR158W	NUC1	P08466	329 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	SPO16	P17122	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	IFA38	P38286	347 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	NPR3	P38742	1146 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	YJR008W	P47085	338 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	COG1	P53079	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	IZH1	Q03419	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	CAC2	Q04199	468 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	SWF1	Q04629	336 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	CRN1	Q06440	651 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	MTF2	P10849	440 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	MRPL36	P36531	177 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	STB2	P46679	850 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPS8	YMR158W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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