RNA–Protein interactions for RNA: YMR135W-A

YMR135W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YMR135W-A, Length 534 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR135W-AYMR135W-A YGR111WP53265 400 aa5.64□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A DAK1P54838 584 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A SOV1Q04748 898 aa5.64□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A RQC1Q05468 723 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A TCO89Q08921 799 aa5.64□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A SVS1Q12254 260 aa5.64□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A ERG27Q12452 347 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A SPE4Q12455 300 aa5.64□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A PGM1P33401 570 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A AUR1P36107 401 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A KTR3P38130 404 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A MAL33P38157 468 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A ZRG8P40021 1076 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A CHS6P40955 746 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A EPL1P43572 832 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A MET12P46151 657 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A YDL183CP48569 320 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A LYS4P49367 693 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A NAM8Q00539 523 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A ATG38Q05789 226 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A MRD1Q06106 887 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A YLR346CQ06139 101 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A MCP2Q06567 569 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A VPS36Q06696 566 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A ATG29Q12092 213 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A YPT6Q99260 215 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A SOD2P00447 233 aa5.62□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A PUT4P15380 627 aa5.62□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A MRPL25P23369 157 aa5.62□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A SEF1P34228 1148 aa5.62□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A YUH1P35127 236 aa5.62□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A GPT2P36148 743 aa5.62□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A COS111P38308 924 aa5.62□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A ERC1P38767 581 aa5.62□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A CCT6P39079 546 aa5.62□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A SEC9P40357 651 aa5.62□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A ALK1P43633 760 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A MLC1P53141 149 aa5.62□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A LSB1P53281 241 aa5.62□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A KAP120Q02932 1032 aa5.62□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A SGO1Q08490 590 aa5.62□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A LEU9Q12166 604 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A MER1P16523 270 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A EST1P17214 699 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A NAR1P23503 491 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A SNT1P25357 1226 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A YJU2P28320 278 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A MET22P32179 357 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A GCD7P32502 381 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A ATG19P35193 415 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A GDT1P38301 280 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A RRT2P38332 387 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A SFB3P38810 929 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A WSS1P38838 269 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A CTF8P38877 133 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A YIL089WP40500 205 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A PKP1P40530 394 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data5.61□□□□□ -1.51not detected
YMR135W-AYMR135W-A DLD2P46681 530 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A RAD17P48581 401 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A CUE3P53137 624 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A LCL3P53153 274 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A TAM41P53230 385 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A UBP2Q01476 1272 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A EGD1Q02642 157 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A KAP95Q06142 861 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A OPT2Q06593 877 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A DCI1Q08558 271 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A UAF30Q08747 228 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A BUD7Q08754 746 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A SWT1Q12104 458 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A YOR019WQ99248 730 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A RPL6BP05739 176 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A GCD1P09032 578 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A CLC1P17891 233 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A ADE2P21264 571 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A WHI3P34761 661 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A GEX2P36173 615 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A GLY1P37303 387 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A OSH7P38755 437 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A YHR078WP38799 552 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A SAK1P38990 1142 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A BIT61P47041 543 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A RCM1P53972 490 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data5.6□□□□□ -1.51not detected
YMR135W-AYMR135W-A RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A YML037CQ03703 340 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A TAP42Q04372 366 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A ECM18Q04623 453 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A MSC3Q05812 728 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A CDA1Q06702 301 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A PEX19Q07418 342 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A RRT8Q08219 342 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR135W-AYMR135W-A CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.6 ms