RNA–Protein interactions for RNA: YKR081C

RPF2, Transcript of Essential protein involved in rRNA maturation and ribosomal assembly, yeast

Gene RPF2, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPF2	YKR081C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	YPT11	P48559	417 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	UBX3	Q12229	455 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	YHL041W	P38730	149 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	ZAP1	P47043	880 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	BOP3	P53958	396 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	NUP53	Q03790	475 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
RPF2	YKR081C	PHO81	P17442	1178 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	YBR138C	P38277	524 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	PUG1	P40100	303 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	PIG1	Q06216	648 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	MCH4	Q08268	501 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	CLB4	P24871	460 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	ASG1	P40467	964 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	UBP8	P50102	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	SNA4	Q07549	140 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	SRL1	Q08673	210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	DSE3	Q08729	430 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	PCT1	P13259	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	YIL152W	P40455	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	GSH2	Q08220	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	BUD7	Q08754	746 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	RGT1	P32862	1170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	NUP120	P35729	1037 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	VPS41	P38959	992 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	ERR3	P42222	437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	SWF1	Q04629	336 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	SWT1	Q12104	458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	SPO16	P17122	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	YCR006C	P25350	157 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	VPS25	P47142	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	STP3	Q05937	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	MLH2	Q07980	695 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	YSP3	P25036	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	MRPL36	P36531	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	NPR3	P38742	1146 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	ACA1	P39970	489 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	CAC2	Q04199	468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	YOL057W	Q08225	711 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	GPA1	P08539	472 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	EXO84	P38261	753 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	SWA2	Q06677	668 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPF2	YKR081C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	MSM1	P22438	575 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	YCL049C	P25577	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	GEX2	P36173	615 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	UBX4	P54730	416 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	POS5	Q06892	414 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	FRE3	Q08905	711 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	PCL6	P40038	420 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	PSF2	P40359	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	ECI1	Q05871	280 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	YCR043C	P25361	127 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	LHS1	P36016	881 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	UBP13	P38187	747 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	MRX1	P40050	688 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	ASE1	P50275	885 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	IZH1	Q03419	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	CIA1	Q05583	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	NUC1	P08466	329 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPF2	YKR081C	GCS1	P35197	352 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.7 ms