RNA–Protein interactions for RNA: YKR062W

TFA2, Transcript of TFIIE small subunit, yeast

Gene TFA2, Length 987 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TFA2	YKR062W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	NBP2	Q12163	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	MBR1	P23493	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	EXO84	P38261	753 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	NET1	P47035	1189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	RAD34	Q06665	692 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	SWA2	Q06677	668 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	TMA16	Q08687	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	RER1	P25560	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	COQ3	P27680	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	SSH4	P32343	579 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	LHS1	P36016	881 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	YPT53	P36019	220 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	MRX1	P40050	688 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	YML131W	Q03102	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	NUS1	Q12063	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	MDM10	P18409	493 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	SCO2	P38072	301 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	STP1	Q00947	519 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	VID22	Q05934	901 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TFA2	YKR062W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	GSH1	P32477	678 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	BUD16	P39988	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	JHD1	P40034	492 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	CIN1	P40987	1014 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	MSY1	P48527	492 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	YNL144C	P53907	740 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	RSC9	Q03124	581 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	REG1	Q00816	1014 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	CRN1	Q06440	651 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	AFT2	Q08957	416 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	CRC1	Q12289	327 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	FRE7	Q12333	620 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	UBP7	P40453	1071 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	PCD1	Q12524	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	MAK32	P23060	363 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	PRE8	P23639	250 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	RRN3	P36070	627 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	YER010C	P40011	234 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	PHM8	P40025	321 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	MNT3	P40549	630 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	UBP8	P50102	471 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	MCH4	Q08268	501 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	SSP2	Q08646	371 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	TRM8	Q12009	286 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	YCR006C	P25350	157 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	YIL024C	P40543	189 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	VPS4	P52917	437 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	CBK1	P53894	756 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	PDR8	Q06149	701 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	OPY2	Q06810	360 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	PFA4	Q12006	378 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	SRB5	P32585	307 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	ARN1	P38731	627 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	ERV46	P39727	415 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	RRI1	Q12468	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	SKM1	Q12469	655 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFA2	YKR062W	ERG8	P24521	451 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	OCT1	P35999	772 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	CFD1	P40558	293 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	VPS25	P47142	202 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	GLO1	P50107	326 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	YPR003C	P53394	754 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	PFA5	Q03289	374 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	VCX1	Q99385	411 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	TOP1	P04786	769 aa		4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.4 ms