RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	NHX1	Q04121	633 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	ARR1	Q06596	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	TGL5	Q12043	749 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	HFI1	Q12060	488 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	NBP2	Q12163	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	PHO5	P00635	467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	TPK1	P06244	397 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	HMX1	P32339	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	MEI5	P32489	222 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	GCS1	P35197	352 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	PCH2	P38126	564 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	DUN1	P39009	513 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	PRM2	P40534	656 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	MET12	P46151	657 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	HNT2	P49775	206 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	CUL3	P53202	744 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SSY1	Q03770	852 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	CRF1	Q04930	467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	TRM8	Q12009	286 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	PSF3	Q12146	194 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YVC1	Q12324	675 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	BIK1	P11709	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	CLB1	P24868	471 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	CLB3	P24870	427 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	CLB4	P24871	460 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	NFS1	P25374	497 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	DMC1	P25453	334 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	PHO91	P27514	894 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	KRE6	P32486	720 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	TGL1	P34163	548 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	OAF3	P36023	863 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YRO2	P38079	344 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	PEX32	P38292	413 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YDR089W	P38966	869 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	PEX7	P39108	375 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	PUG1	P40100	303 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	SDS3	P40505	327 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	SPO22	P40511	975 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YFH7	P43591	353 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	STU2	P46675	888 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	NIT3	P49954	291 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	MTC3	P53077	123 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	MLC1	P53141	149 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	VPS75	P53853	264 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YNL144C	P53907	740 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	DON1	Q05610	365 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	OMS1	Q06668	471 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	GLE1	Q12315	538 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	GAL7	P08431	366 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	SNF3	P10870	884 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	PRO1	P32264	428 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	DOA4	P32571	926 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	REC104	P33323	182 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	SRB2	P34162	210 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	EMC3	P36039	253 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	STB6	P36085	766 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	ECM4	P36156	370 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YBR138C	P38277	524 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YHL017W	P38745	532 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	TCD1	P38756	429 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YHR202W	P38887	602 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	HXT7	P39004	570 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YIL089W	P40500	205 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	NAS2	P40555	220 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YIR042C	P40586	236 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YFL052W	P43551	465 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	TAD1	P53065	400 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YGL242C	P53066	181 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	RIM8	P53179	542 aa		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.6 ms