RNA–Protein interactions for RNA: YGL050W

TYW3, Transcript of tRNA methyltransferase required for synthesis of wybutosine, yeast

Gene TYW3, Length 822 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TYW3	YGL050W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	ADA2	Q02336	434 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	ATP25	Q03153	612 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	MUB1	Q03162	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	PRM6	Q04705	352 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	PIG1	Q06216	648 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	CDD1	Q06549	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	APC5	Q08683	685 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	PDE1	P22434	369 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	PGS1	P25578	521 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	VBA3	P25594	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	GYP6	P32806	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	MSS4	P38994	779 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	CAJ1	P39101	391 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	YTA12	P40341	825 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	YIR016W	P40572	265 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	POL31	P46957	487 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	MND1	P53102	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	ARO80	Q04052	950 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	VPS38	Q05919	439 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	GPM2	Q12008	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	HRT3	Q12347	344 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	CHS1	P08004	1131 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	SPO12	P17123	173 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	CDC42	P19073	191 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	TKL2	P33315	681 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	YKL050C	P35736	922 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	YMC2	P38087	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	AGP2	P38090	596 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	TDA3	P38758	523 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	YHR078W	P38799	552 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	SAP185	P40856	1058 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	HXT16	P47185	567 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	PUS2	P53167	370 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	SUN4	P53616	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	ERG5	P54781	538 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	NSE5	Q03718	556 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TYW3	YGL050W	HMG2	P12684	1045 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	SRB4	P32569	687 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	GCS1	P35197	352 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	MOB1	P40484	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	GUF1	P46943	645 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	YGR021W	P53212	290 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	YGR111W	P53265	400 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	YNL034W	P53963	612 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	YNL018C	P53976	612 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	PPM1	Q04081	328 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	ERV41	Q04651	352 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	REH1	Q06709	432 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	PUS9	Q12069	462 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	NBP2	Q12163	236 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	APM4	Q99186	491 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	LAA1	P39526	2014 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	TPK1	P06244	397 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	AEP2	P22136	580 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	PEX1	P24004	1043 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	DBF4	P32325	704 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	PEX2	P32800	271 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	BLI1	P35727	113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	DSE1	P40077	573 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	MAF1	P41910	395 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	ALF1	P53904	254 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	THI20	Q08224	551 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	DDC1	Q08949	612 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	THI21	Q08975	551 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	APL4	Q12028	832 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	KAR3	P17119	729 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	PEX34	P25584	144 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	CTF13	P35203	478 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	YBR056W	P38081	501 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW3	YGL050W	HIS2	P38635	335 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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