RNA–Protein interactions for RNA: YDR532C

KRE28, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeast

Gene KRE28, Length 1,158 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KRE28	YDR532C	DAP1	Q12091	152 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	HIF1	Q12373	385 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	WHI2	P12611	486 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	HMG1	P12683	1054 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	STE4	P18851	423 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	GAA1	P39012	614 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	ESL1	P40456	1118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	BUD6	P41697	788 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	AIM14	P53109	570 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	RPN4	Q03465	531 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	VHS3	Q08438	674 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	CLN3	P13365	580 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	PCL2	P25693	308 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	PET127	P32606	800 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	UBP11	P36026	717 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	PCI8	P40512	444 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	SAD1	P43589	448 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	CEX1	Q12453	761 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	POL3	P15436	1097 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	ADK2	P26364	225 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
KRE28	YDR532C	OPY1	P38271	328 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	BUD16	P39988	312 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	OPT1	P40897	799 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	LAM5	P43560	674 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	YGL138C	P53122	345 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	PGA2	P53903	129 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	PNG1	Q02890	363 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	UGO1	Q03327	502 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	PIG1	Q06216	648 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	MSH2	P25847	964 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	CSE2	P33308	149 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	PEX6	P33760	1030 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	BEM4	P39011	633 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	YNL034W	P53963	612 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	YNL018C	P53976	612 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	TRS23	Q03784	219 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	TIP41	Q12199	356 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	PCD1	Q12524	340 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	MRPL7	P36519	292 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	NUP82	P40368	713 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	FIS1	P40515	155 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	PMA2	P19657	947 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	RPC53	P25441	422 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	BEM3	P32873	1128 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	CCL1	P37366	393 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	SLX1	P38324	304 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	YHL026C	P38740	315 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	RIM4	P38741	713 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	THI6	P41835	540 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	MEP2	P41948	499 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	RET3	P53600	189 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	ATP23	P53722	227 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	SDH5	Q08230	162 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	FRE7	Q12333	620 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	PHO8	P11491	566 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	SFL1	P20134	766 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
KRE28	YDR532C	HEL1	P36113	551 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	VID24	P38263	362 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	SIP3	P38717	1229 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	YIR016W	P40572	265 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	ATG36	P46983	293 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	CTF18	P49956	741 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRE28	YDR532C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65

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