RNA–Protein interactions for RNA: YBL003C

HTA2, Transcript of Histone H2A, yeast

Gene HTA2, Length 399 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HTA2	YBL003C	IME4	P41833	600 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	ZIM17	P42844	174 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	MTL1	P53214	551 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	PLB2	Q03674	706 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	HMI1	Q12039	706 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	PDE1	P22434	369 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	CPR2	P23285	205 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	SYN8	P31377	255 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	RRF1	P38771	230 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	LNP1	P38878	278 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	BUD16	P39988	312 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	LCB2	P40970	561 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	SAE2	P46946	345 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	INP52	P50942	1183 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	VPS62	P53285	467 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	GTB1	Q04924	702 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	CRF1	Q04930	467 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	HOF1	Q05080	669 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	VPS38	Q05919	439 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	AVL9	Q12500	764 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HTA2	YBL003C	SOD2	P00447	233 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	STE12	P13574	688 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	KAR3	P17119	729 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	YIH1	P25637	258 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.74	RIP-Chip
HTA2	YBL003C	UIP5	P36137	443 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	FTH1	P38310	465 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	REV7	P38927	245 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	MEF2	P39677	819 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	FKH2	P41813	862 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	THI6	P41835	540 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	CTH1	P47976	325 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	VID30	P53076	958 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	TAM41	P53230	385 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	INA17	Q02888	182 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	ESC8	Q08119	714 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	ATG29	Q12092	213 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	NFI1	Q12216	726 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	YPT6	Q99260	215 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	CMC1	P36064	111 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	GEX2	P36173	615 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	SDH8	P38345	138 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	DOT5	P40553	215 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	RFX1	P48743	811 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	CUL3	P53202	744 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	TWF1	P53250	332 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
HTA2	YBL003C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	YML037C	Q03703	340 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	DLT1	Q04216	342 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	VTI1	Q04338	217 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	APL4	Q12028	832 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	BAG7	Q12128	409 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	FRE6	Q12473	712 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	ABF1	P14164	731 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	VMA16	P23968	213 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	KAR4	P25583	335 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	SMI1	P32566	505 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	TFB1	P32776	642 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	DAD2	P36162	133 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	FMO1	P38866	432 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	PLB1	P39105	664 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	AFG3	P39925	761 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	RIA1	P53893	1110 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	BOP3	P53958	396 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	MAK10	Q02197	733 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
HTA2	YBL003C	ARG7	Q04728	441 aa		4.19	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.5 ms