RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C RTT107P38850 1070 aa7.08□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C ELO3P40319 345 aa7.08□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C BUD13P46947 266 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C CIS3P47001 227 aa7.08□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C PCL10P53124 433 aa7.08□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C TEP1P53916 434 aa7.08□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C NGL3Q03210 505 aa7.08□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C ENT5Q03769 411 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C THI7Q05998 598 aa7.08□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C OPY2Q06810 360 aa7.08□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data7.08□□□□□ -1.28not detected
SPE3YPR069C TRA1P38811 3744 aa7.07□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C TRM1P15565 570 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C STE4P18851 423 aa7.07□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C DBF4P32325 704 aa7.07□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C MSR1P38714 643 aa7.07□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C ELO1P39540 310 aa7.07□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C SPC72P39723 622 aa7.07□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C ATM1P40416 690 aa7.07□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C TRF5P48561 642 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C STR3P53101 465 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C COX5AP00424 153 aa7.06□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C YCR015CP25616 317 aa7.06□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C SCD5P34758 872 aa7.06□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C MRPL10P36520 322 aa7.06□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C HIS2P38635 335 aa7.06□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C PPE1P38796 400 aa7.06□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C LRP1P38801 184 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C CCT6P39079 546 aa7.06□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C RPH1P39956 796 aa7.06□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C YGR127WP53275 312 aa7.06□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C NOG2P53742 486 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C YNL143CP53908 130 aa7.06□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data7.06□□□□□ -1.28not detected
SPE3YPR069C ATG9Q12142 997 aa7.06□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C YDR061WQ12298 539 aa7.06□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C MPH2P0CD99 609 aa7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C GAL11P19659 1081 aa7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C DAL82P21705 255 aa7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C MRS6P32864 603 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C IRS4P36115 615 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C SET5P38890 526 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C YMR124WP39523 943 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C ARG2P40360 574 aa7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C MKT1P40850 830 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C VNX1P42839 908 aa7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C ROK1P45818 564 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C STR2P47164 639 aa7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C VAC7P53950 1165 aa7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C ERG5P54781 538 aa7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C TGL2P54857 326 aa7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C UFO1Q04511 668 aa7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C LDB18Q07887 179 aa7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C AAD15Q08361 143 aa7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C TFB4Q12004 338 aa7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C VPS68Q12016 184 aa7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C DAS2Q12084 232 aa7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C FRT1Q99332 602 aa7.05□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C GLN4P13188 809 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C ABF1P14164 731 aa7.04□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C RKM3P38222 552 aa7.04□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C ECM2P38241 364 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C PCA1P38360 1216 aa7.04□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C SRP72P38688 640 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C OTU2P38747 307 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C ATG3P40344 310 aa7.04□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C MND2P40577 368 aa7.04□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C COG1P53079 417 aa7.04□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C SWC4P53201 476 aa7.04□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C JJJ1P53863 590 aa7.04□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C MSH6Q03834 1242 aa7.04□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data7.04□□□□□ -1.28not detected
SPE3YPR069C TUB1P09733 447 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C TUB3P09734 445 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C ERG11P10614 530 aa7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C PMS1P14242 873 aa7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data7.03□□□□□ -1.28not detected
SPE3YPR069C SFL1P20134 766 aa7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C UBA1P22515 1024 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C PPH21P23594 369 aa7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C RBK1P25332 333 aa7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C EMC1P25574 760 aa7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C AEP1P32493 518 aa7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C ARL1P38116 183 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C UBS1P38290 277 aa7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C RRT2P38332 387 aa7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C STN1P38960 494 aa7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C FLC2P39719 783 aa7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C SLX8P40072 274 aa7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C NUP85P46673 744 aa7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C GND2P53319 492 aa7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C BNI4P53858 892 aa7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C MET14Q02196 202 aa7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C UTP5Q04177 643 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C YPR148CQ06523 435 aa7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C SKM1Q12469 655 aa7.03□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C SCL1P21243 252 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C SLY1P22213 666 aa7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.4 ms