RNA–Protein interactions for RNA: YOL013C

HRD1, Transcript of Ubiquitin-protein ligase, yeast

Gene HRD1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HRD1	YOL013C	AAD4	Q07747	329 aa		3.56	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	ISA2	Q12425	185 aa		3.56	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	APE1	P14904	514 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	GCS1	P35197	352 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	TAF5	P38129	798 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	SRO77	P38163	1010 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	NPR3	P38742	1146 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	SFB3	P38810	929 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	YNL195C	P40168	261 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	GID8	P40208	455 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	ARG2	P40360	574 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	BUD8	P41698	603 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	CTR1	P49573	406 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	CDC45	Q08032	650 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	SKM1	Q12469	655 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	SGS1	P35187	1447 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	TPK1	P06244	397 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	YCK1	P23291	538 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	ADK2	P26364	225 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	MRP20	P32387	263 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	MDL1	P33310	695 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	APN2	P38207	520 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	YJL206C	P39529	758 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	ATF1	P40353	525 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	TAH11	P47112	604 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	IMA1	P53051	589 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	COG1	P53079	417 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	RAD30	Q04049	632 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	ARP9	Q05123	467 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	REX3	Q12090	404 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	YOR111W	Q99210	232 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	PEX1	P24004	1043 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	STB6	P36085	766 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	GLG1	P36143	616 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	MRPL36	P36531	177 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	YEL057C	P39983	233 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	BST1	P43571	1029 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	GYL1	Q04322	720 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	TRI1	Q05024	226 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	SKG3	Q06315	1026 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	VPS36	Q06696	566 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	HUA2	Q12134	243 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	SUT2	Q12286	268 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	SFI1	Q12369	946 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	ZRT2	Q12436	422 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	GRX6	Q12438	231 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	FRE6	Q12473	712 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	PCK1	P10963	549 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	KAR3	P17119	729 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	STE50	P25344	346 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.53	□□□□□ -1.84	not detected
HRD1	YOL013C	PHO11	P35842	467 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	PHO12	P38693	467 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	TAF4	P50105	388 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	PEF1	P53238	335 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	COX18	P53239	316 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	FHN1	P53279	174 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	ATG4	P53867	494 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	REG1	Q00816	1014 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	OAZ1	Q02803	292 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	PEX25	Q02969	394 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	YML119W	Q03208	357 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	CTI6	Q08923	506 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	TAF3	Q12297	353 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
HRD1	YOL013C	YLR302C	O13544	120 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HRD1	YOL013C	STF1	P01098	86 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HRD1	YOL013C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HRD1	YOL013C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HRD1	YOL013C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HRD1	YOL013C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HRD1	YOL013C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HRD1	YOL013C	PEP3	P27801	918 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HRD1	YOL013C	PPZ2	P33329	710 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HRD1	YOL013C	CDS1	P38221	457 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HRD1	YOL013C	STB5	P38699	743 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HRD1	YOL013C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HRD1	YOL013C	YHR218W	P38899	603 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HRD1	YOL013C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.52	□□□□□ -1.85	not detected
HRD1	YOL013C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85

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