RNA–Protein interactions for RNA: YMR066W

SOV1, Transcript of Mitochondrial protein of unknown function, yeast

Gene SOV1, Length 2,697 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOV1	YMR066W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YMR010W	Q03687	405 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	VHS1	Q03785	461 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SND1	Q04007	877 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	NSE3	Q05541	303 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YLR407W	Q06070	228 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	VAM6	Q07468	1049 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	CDC45	Q08032	650 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YPL191C	Q08930	360 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	RTC1	Q08281	1341 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YCR043C	P25361	127 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YCR061W	P25639	631 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	GSY2	P27472	705 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	TFC3	P34111	1160 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YKL050C	P35736	922 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YKL069W	P36088	180 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	CHK1	P38147	527 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	FAA2	P39518	744 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	EAF5	P39995	279 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YJL070C	P40361	888 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SMC3	P47037	1230 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YJR039W	P47107	1121 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	MKC7	P53379	596 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SKY1	Q03656	742 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YPS7	Q06325	596 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YLR112W	Q12130	139 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	VPS5	Q92331	675 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	HMG1	P12683	1054 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	HMG2	P12684	1045 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SPO16	P17122	198 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	CWH43	P25618	953 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	MSH2	P25847	964 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	PDR3	P33200	976 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YBL059W	P34224	193 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SWH1	P35845	1188 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	ICS2	P38284	255 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	PCA1	P38360	1216 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	MIT1	P40002	666 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	CAB2	P40506	365 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	DJP1	P40564	432 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	GSM1	P42950	618 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SAP4	P53036	818 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	MNT2	P53059	558 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YNL193W	P53870	558 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	ECM11	Q04110	302 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	IOC4	Q04213	475 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YMR254C	Q04838	102 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	CRF1	Q04930	467 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	HRD3	Q05787	833 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	TRE2	Q08693	809 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	NUS1	Q12063	375 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	FRE7	Q12333	620 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	ADR1	P07248	1323 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	RAP1	P11938	827 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	ARG1	P22768	420 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	MBR1	P23493	339 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	MRC1	P25588	1096 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YEL045C	P32616	141 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	VPS17	P32913	551 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	STE5	P32917	917 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SEF1	P34228	1148 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YKL097C	P34245	136 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	OCT1	P35999	772 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SDH8	P38345	138 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	FTR1	P40088	404 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	PRM2	P40534	656 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	VID28	P40547	921 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	AXL1	P40851	1208 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YJL213W	P40896	331 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	IKS1	P47042	667 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SDT1	P53078	280 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	RSM28	Q03430	361 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YMR027W	Q04371	470 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	RSF1	Q05043	376 aa		0.26	□□□□□ -2.37

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