RNA–Protein interactions for RNA: YKR055W

RHO4, Transcript of Non-essential small GTPase, yeast

Gene RHO4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RHO4	YKR055W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	ATG16	Q03818	150 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	ARP10	Q04549	284 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	GAD1	Q04792	585 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YLR001C	Q07895	862 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	AEP3	Q12089	606 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	MED2	Q12124	431 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YPL150W	Q12152	901 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	HMS1	Q12398	434 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	ARP7	Q12406	477 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.76	□□□□□ -1.49	not detected
RHO4	YKR055W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	CDC4	P07834	779 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	HMG2	P12684	1045 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	AEP2	P22136	580 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	PRD1	P25375	712 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	SPS22	P25380	463 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	PRR1	P28708	518 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	SRB4	P32569	687 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	RRN6	P32786	894 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	MDJ1	P35191	511 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	CHK1	P38147	527 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	HSE1	P38753	452 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	LNP1	P38878	278 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	AIM2	P39721	246 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	ALG5	P40350	334 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	EFM4	P40516	257 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	CIN5	P40917	295 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	TDA10	P42938	290 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	FMP32	P43557	207 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	NIT3	P49954	291 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	TBF1	Q02457	562 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YMR010W	Q03687	405 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	BNA7	Q04066	261 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YDR514C	Q04408	483 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	URC2	Q04411	772 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	SPO77	Q06134	477 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	NDE2	Q07500	545 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YAP7	Q08182	245 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	REC8	Q12188	680 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	TRP3	P00937	484 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	STE3	P06783	470 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	MPH2	P0CD99	609 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	MTF2	P10849	440 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YAK1	P14680	807 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	VMA16	P23968	213 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	DBF20	P32328	564 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	PAH1	P32567	862 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	MRPL7	P36519	292 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	MRPL37	P36532	105 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	COS111	P38308	924 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.75	□□□□□ -1.49	not detected
RHO4	YKR055W	SMF2	P38778	549 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	VMA7	P39111	118 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	GDH3	P39708	457 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YKE2	P52553	114 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	MNT2	P53059	558 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	NUT1	P53114	1132 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	MNT4	P53745	580 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	RSC4	Q02206	625 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	CSI1	Q04368	295 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	GMC2	Q06201	188 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YFT2	Q06676	274 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YPR091C	Q06833	770 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	SSP2	Q08646	371 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	AKR2	Q12013	749 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	RUP1	Q12242	671 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	NCA2	Q12374	616 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	SEM1	O94742	89 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	BI4	P03879	638 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	VAM7	P32912	316 aa		5.74	□□□□□ -1.49

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