RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HCA4	YJL033W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	YHR033W	P38690	423 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	YJR120W	P47157	116 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	SLD3	P53135	668 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	HLR1	Q04429	423 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	SFH1	Q06168	426 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	ARR1	Q06596	294 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	IZH3	Q07959	543 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	ATG9	Q12142	997 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	NCB2	Q92317	146 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	RDS1	P25611	832 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	PCH2	P38126	564 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	EMP65	P40085	556 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	YIL166C	P40445	542 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	PRM2	P40534	656 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	YGL242C	P53066	181 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	EXO84	P38261	753 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
HCA4	YJL033W	FTR1	P40088	404 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	TAH11	P47112	604 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	COG6	P53959	839 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	SEC5	P89102	971 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	GGA1	Q06336	557 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	CIR2	Q08822	631 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	ATP12	P22135	325 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	HXT4	P32467	576 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	SEC66	P33754	206 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	NMA2	P53204	395 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	DIP5	P53388	608 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	SPC98	P53540	846 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	INP2	Q03824	705 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	UFO1	Q04511	668 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	AIM41	Q12032	185 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	RKI1	Q12189	258 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	FKS3	Q04952	1785 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	RPN13	O13563	156 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	BRF1	P29056	596 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	CDS1	P38221	457 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	YER130C	P39959	443 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	TMN3	P40071	706 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	FOL1	P53848	824 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	BET4	Q00618	327 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	RMT2	Q03305	412 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	APL4	Q12028	832 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	GLE1	Q12315	538 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HCA4	YJL033W	PMR1	P13586	950 aa		4.09	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	TOA1	P32773	286 aa		4.09	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	ELF1	P36053	145 aa		4.09	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	WAR1	Q03631	944 aa		4.09	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	KRE28	Q04431	385 aa		4.09	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	ATG23	Q06671	453 aa		4.09	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	SUT2	Q12286	268 aa		4.09	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	NKP1	Q12493	238 aa		4.09	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	JIP3	O13555	125 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	KAR1	P11927	433 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	RPO26	P20435	155 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	CLN1	P20437	546 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	KAR9	P32526	644 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	ECM4	P36156	370 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	ILM1	P47155	203 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	PEX14	P53112	341 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	LAM4	P38800	1345 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	GPA1	P08539	472 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	TUP1	P16649	713 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	ARG1	P22768	420 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	CLB4	P24871	460 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	CDC15	P27636	974 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	MTC7	P32633	139 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	THI6	P41835	540 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	IRC5	P43610	853 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HCA4	YJL033W	YJR079W	P47126	109 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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