RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	PMT1	P33775	817 aa		6	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	IRC24	P40580	263 aa		6	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	AMA1	P50082	593 aa		6	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	EMC4	P53073	190 aa		6	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	COG7	P53195	279 aa		6	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	PIR1	Q03178	341 aa		6	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	YOL075C	Q08234	1294 aa		6	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	6	□□□□□ -1.45	not detected
SYF2	YGR129W	GPR1	Q12361	961 aa		6	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	LSO1	Q3E827	93 aa		6	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.99	□□□□□ -1.45	not detected
SYF2	YGR129W	ABF1	P14164	731 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	CWP1	P28319	239 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.99	□□□□□ -1.45	not detected
SYF2	YGR129W	SMC1	P32908	1225 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	LAM1	P38851	1228 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	STL1	P39932	569 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	STU2	P46675	888 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	COS5	P47187	383 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	AIM14	P53109	570 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	PRM1	P53835	661 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	GNT1	Q12096	491 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	SKM1	Q12469	655 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	CYC7	P00045	113 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	YER152C	P10356	443 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	BEM1	P29366	551 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	TAE1	P38340	232 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	ELO1	P39540	310 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	BOL3	P39724	118 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	YEL075C	P39972	122 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	YJR124C	P47159	448 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	NCE103	P53615	221 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	VPS20	Q04272	221 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	BRE4	Q07660	1125 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	ATG10	Q07879	167 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	RPL43B	P0CX26	92 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	ERS1	P17261	260 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	MRP4	P32902	394 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	VAC8	P39968	578 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	NBP35	P52920	328 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	YNR063W	P53749	607 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	SUR7	P54003	302 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	KTR6	P54070	446 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	ORC3	P54790	616 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	RSM10	Q03201	203 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	YLR297W	Q05899	129 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	YOL073C	Q08232	322 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	EMP46	Q12396	444 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	PEX11	Q12462	236 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	APM3	P38153	483 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	HSL7	P38274	827 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	DOS2	P54858	310 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.96	□□□□□ -1.46	not detected
SYF2	YGR129W	ADI1	Q03677	179 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	COG4	Q06096	861 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	THI20	Q08224	551 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	FRE7	Q12333	620 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	MIH1	P23748	554 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	SLD2	P34252	453 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	NPR3	P38742	1146 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	SNG1	P46950	547 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	GLG2	P47011	380 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	MNT2	P53059	558 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	HOP2	P53187	214 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	ARA2	Q04212	335 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	GLO4	Q12320	285 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	SFI1	Q12369	946 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	SRB2	P34162	210 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	CHS7	P38843	316 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	ALR2	P43553	858 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	CNN1	P43618	361 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	PUS2	P53167	370 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	YTP1	P53584	459 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	YDR131C	Q03899	556 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	AAD4	Q07747	329 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	PPH21	P23594	369 aa		5.93	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	ADD66	P36040	267 aa		5.93	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	PXL1	P36166	706 aa		5.93	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	PCA1	P38360	1216 aa		5.93	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	RAD26	P40352	1085 aa		5.93	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	YMR018W	Q04364	514 aa		5.93	□□□□□ -1.46

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