RNA–Protein interactions for RNA: YDR532C

KRE28, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeast

Gene KRE28, Length 1,158 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KRE28	YDR532C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	POM34	Q12445	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	SRD1	P09007	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	MEF1	P25039	761 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	NTH1	P32356	751 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	HOT13	P36078	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	DSS1	P39112	969 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	DIP5	P53388	608 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	SNF12	P53628	566 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	ARP5	P53946	755 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	ARG7	Q04728	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	DSE3	Q08729	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	CIR2	Q08822	631 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	MNN4	P36044	1178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	DRE2	P36152	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	YHR131C	P38835	850 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	ASE1	P50275	885 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	YGL081W	P53156	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	MDR1	P53258	950 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	SKY1	Q03656	742 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	UFO1	Q04511	668 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	YFT2	Q06676	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	VPS36	Q06696	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	CRD1	Q07560	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	RIF1	P29539	1916 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	TVP38	P36164	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	BRN1	P38170	754 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	COS111	P38308	924 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	TVP23	P38962	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	STP1	Q00947	519 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	CSM3	Q04659	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	MSS51	P32335	436 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	YPT7	P32939	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	YEL1	P34225	687 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	FMP10	P40098	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	VID28	P40547	921 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	ALT2	P52892	507 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	AIM33	Q04516	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	YLH47	Q06493	454 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	ARP6	Q12509	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	SEC15	P22224	910 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	AAD3	P25612	363 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	YHR202W	P38887	602 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	EPL1	P43572	832 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	STB2	P46679	850 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	NNF1	P47149	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	MET13	P53128	600 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	YGL117W	P53133	265 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	COG8	Q04632	607 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	IZH3	Q07959	543 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE28	YDR532C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	KIN82	P25341	720 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	URK1	P27515	501 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	EAF5	P39995	279 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	SPO22	P40511	975 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	BIT61	P47041	543 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	CPR8	P53728	308 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	MFM1	Q02783	413 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	ATG33	Q06485	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	SMC5	Q08204	1093 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	GEP3	Q08622	556 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	DCS2	Q12123	353 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	SYN8	P31377	255 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	BUD2	P33314	1104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	ELF1	P36053	145 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	RXT2	P38255	430 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	VID30	P53076	958 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	PHM6	Q05637	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	ORM2	Q06144	216 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	MMR1	Q06324	491 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE28	YDR532C	HFI1	Q12060	488 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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