RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 ITIH3Q06033 890 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 IRX4P78413 519 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 MAN1A1P33908 653 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 C8orf58Q8NAV2 365 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 FAM81BQ96LP2 452 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 MYL1P05976 194 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PAK2Q13177 524 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 IFNKQ9P0W0 207 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 NECAB1Q8N987 351 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 LPIN2Q92539 896 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TNFAIP3P21580 790 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ALDH1B1P30837 517 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 LMNTD2Q8IXW0 634 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 KBTBD3Q8NAB2 608 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PZPP20742 1482 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PPFIA4O75335 1185 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TTC38Q5R3I4 469 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM58Q8NG06 486 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TESK2Q96S53 571 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 LAMC1P11047 1609 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ITGA6P23229 1130 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CALCRLQ16602 461 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CUEDC2Q9H467 287 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 YEATS2Q9ULM3 1422 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PHBP35232 272 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 POSTNQ15063 836 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 DNM3Q9UQ16 869 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ARID5AQ03989 594 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 GBP6Q6ZN66 633 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ASIC2Q16515 512 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC89Q8N998 374 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC2Q9BYS8 371 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 MAGI2Q86UL8 1455 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PTGS1P23219 599 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TMC4Q7Z404 712 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 NOD1Q9Y239 953 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PPFIA3O75145 1194 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1B0GVL5 298 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 SGSM2O43147 1006 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 KRT5P13647 590 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 APOBRQ0VD83 1088 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 MUM1L1Q5H9M0 696 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ANKARQ7Z5J8 1434 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 SPATA5Q8NB90 893 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ADCY10Q96PN6 1610 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 BBOF1Q8ND07 529 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 C8orf37Q96NL8 207 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 STK32BQ9NY57 414 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 PTPRTO14522 1441 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1B0GUL7 405 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CHL1O00533 1208 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CA8P35219 290 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 NEDD9Q14511 834 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 GNPTABQ3T906 1256 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 VPS52Q8N1B4 723 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.67□□□□□ -1.34
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