RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dph3Q8K0W9 82 aa12,67□□□□□ -0,38
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Defb39Q70KL3 74 aa12,64□□□□□ -0,39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc179J3QM76 67 aa12,62□□□□□ -0,39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm16253D3Z167 63 aa12,6□□□□□ -0,39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnah5Q8VHE6 4621 aa12,58□□□□□ -0,4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krtap14O08640 167 aa12,58□□□□□ -0,4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Anapc11Q9CPX9 84 aa12,57□□□□□ -0,4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igkv3-3A0A140T8Q0 119 aa12,55□□□□□ -0,4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10197F6QEY5 67 aa12,51□□□□□ -0,41
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10267M0QWD8 85 aa12,51□□□□□ -0,41
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chtf8P0CG14 533 aa12,5□□□□□ -0,41
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bean1Q9EQG5 255 aa12,5□□□□□ -0,41
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vps13dB1ART2 4390 aa12,48□□□□□ -0,41
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hectd4E9Q2E4 4418 aa12,46□□□□□ -0,41
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10337F7DEP7 55 aa12,46□□□□□ -0,41
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 OxtP35454 125 aa12,44□□□□□ -0,42
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnah2P0C6F1 4456 aa12,43□□□□□ -0,42
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krtap13O88375 197 aa12,42□□□□□ -0,42
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mrpl55Q9CZ83 127 aa12,4□□□□□ -0,42
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10160F6Y577 67 aa12,37□□□□□ -0,43
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ApobE9Q414 4505 aa12,36□□□□□ -0,43
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 H2al1bA0A087WP11 105 aa12,35□□□□□ -0,43
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 H2al1kJ3QP08 105 aa12,35□□□□□ -0,43
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 H2al1eQ810S6 105 aa12,35□□□□□ -0,43
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 H2al1mQ9DAD9 105 aa12,35□□□□□ -0,43
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krtap10-10A0A1W2P7T6 217 aa12,35□□□□□ -0,43
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pkd1O08852 4293 aa12,35□□□□□ -0,43
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm2696A0A1W2P709 240 aa12,32□□□□□ -0,44
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Phxr4P15974 95 aa12,3□□□□□ -0,44
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cypt15B1AXS0 87 aa12,26□□□□□ -0,45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spaca4Q80ZQ0 127 aa12,23□□□□□ -0,45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Defb38Q7TNV7 63 aa12,21□□□□□ -0,45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stard9Q80TF6 4561 aa12,21□□□□□ -0,45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Defb13Q8R2I4 64 aa12,19□□□□□ -0,46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10643Q3URG9 111 aa12,15□□□□□ -0,47
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrp1bQ9JI18 4599 aa12,14□□□□□ -0,47
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sox16Q62247 57 aa12,09□□□□□ -0,47
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm20661K7N787 53 aa12,08□□□□□ -0,48
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm21798J3QNU5 87 aa12,07□□□□□ -0,48
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pkhd1E9PZ36 4059 aa12,05□□□□□ -0,48
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4933415A04RikQ9D443 101 aa12,04□□□□□ -0,48
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dync1h1Q9JHU4 4644 aaKnown RBP12,03□□□□□ -0,48
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fat1A0A1L1SQU7 4645 aa12,03□□□□□ -0,48
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wfdc3Q14AE4 130 aa11,99□□□□□ -0,49
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fat2Q5F226 4351 aa11,93□□□□□ -0,5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ryr3A2AGL3 4863 aa11,92□□□□□ -0,5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SacsQ9JLC8 4582 aa11,9□□□□□ -0,5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ndufb1P0DN34 57 aa11,9□□□□□ -0,5
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RetnlbQ99P86 105 aa11,87□□□□□ -0,51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10999F6Q4M4 69 aa11,86□□□□□ -0,51
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rps29P62274 56 aa11,81□□□□□ -0,52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SptssbQ925E8 76 aa11,81□□□□□ -0,52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Limd2Q8BGB5 128 aa11,8□□□□□ -0,52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Uqcr11Q9CPX8 56 aa11,8□□□□□ -0,52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krtap3-2Q9D638 99 aa11,8□□□□□ -0,52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krtap3-3Q9D7P0 99 aa11,8□□□□□ -0,52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q8BGJ3 129 aa11,79□□□□□ -0,52
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2310034C09RikQ9D746 214 aa11,77□□□□□ -0,53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2310079G19RikQ9D6L6 185 aa11,74□□□□□ -0,53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm26620Q9CY65 116 aa11,74□□□□□ -0,53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 A930033H14RikG5E8X6 103 aa11,71□□□□□ -0,53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ryr2E9Q401 4966 aaKnown RBP11,7□□□□□ -0,54
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm11939A2A592 99 aa11,62□□□□□ -0,55
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pkhd1l1Q80ZA4 4249 aa11,61□□□□□ -0,55
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4930507D05RikQ8C9C9 103 aa11,6□□□□□ -0,55
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm4491E0CX42 125 aa11,56□□□□□ -0,56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3646F6S692 53 aa11,53□□□□□ -0,56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vps13bQ80TY5 3993 aa11,53□□□□□ -0,56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Defb1P56386 69 aa11,52□□□□□ -0,56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 D6Ertd527eA0A0N4SWI3 464 aa11,48□□□□□ -0,57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krtap19-5O08632 62 aa11,48□□□□□ -0,57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kmt2cQ8BRH4 4903 aa11,47□□□□□ -0,57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrp1Q91ZX7 4545 aaKnown RBP11,45□□□□□ -0,58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ryr1E9PZQ0 5035 aa11,39□□□□□ -0,59
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm5767A0A0J9YTU8 78 aa11,33□□□□□ -0,6
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fat3Q8BNA6 4555 aa11,28□□□□□ -0,6
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnah8Q91XQ0 4731 aa11,27□□□□□ -0,61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm9736A0A1W2P7N1 277 aa11,26□□□□□ -0,61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1700042G07RikB1AUF7 90 aa11,25□□□□□ -0,61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ndufs5Q99LY9 106 aa11,22□□□□□ -0,61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abca13Q5SSE9 5034 aa11,18□□□□□ -0,62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 9230102O04RikA2ASX7 82 aa11,18□□□□□ -0,62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cox6b2Q80ZN9 88 aa11,16□□□□□ -0,62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sec61gP60060 68 aa11,11□□□□□ -0,63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm5965D3Z724 196 aa11,08□□□□□ -0,64
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mycbp2Q7TPH6 4711 aa11,05□□□□□ -0,64
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpl37Q9D823 97 aa11,01□□□□□ -0,65
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnase13Q5GAM7 153 aa10,99□□□□□ -0,65
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krtap15-1Q9QZU5 150 aa10,96□□□□□ -0,66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pla2g10Q9QXX3 151 aa10,92□□□□□ -0,66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm20537G3UYK7 97 aa10,88□□□□□ -0,67
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa10,85□□□□□ -0,67
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kiaa1109A2AAE1 5005 aa10,85□□□□□ -0,67
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Herc2Q4U2R1 4836 aa10,83□□□□□ -0,68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm17416Q30KP4 66 aa10,8□□□□□ -0,68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Birc6O88738 4882 aa10,8□□□□□ -0,68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm17606F6ZL36 78 aa10,77□□□□□ -0,69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm9821Q8K076 103 aa10,75□□□□□ -0,69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10382Q3V0T5 144 aa10,74□□□□□ -0,69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm9955Q8CEJ8 102 aa10,74□□□□□ -0,69
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 68 ms