RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NischQ80TM9 1593 aa41,81■■■■■ 4,28
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ScribQ80U72 1612 aa37,42■■■■□ 3,58
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc180J3QNE4 1664 aa37,11■■■■□ 3,53
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kdm5dQ62240 1548 aa36,6■■■■□ 3,45
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NacadQ5SWP3 1504 aa36,37■■■■□ 3,41
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Crybg2B7ZCC2 1516 aa35,62■■■■□ 3,29
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sycp2Q9CUU3 1500 aa35,6■■■■□ 3,29
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa35,37■■■■□ 3,25
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smarca2Q6DIC0 1577 aa35,33■■■■□ 3,25
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HrcG5E8J6 738 aa35,18■■■■□ 3,22
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BicraF8VPZ9 1578 aa34,87■■■■□ 3,17
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP34,07■■■■□ 3,05
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cngb1E1AZ71 1325 aa33,88■■■■□ 3,01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP33,82■■■■□ 3,01
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa33,62■■■□□ 2,97
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa33,32■■■□□ 2,92
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fmn1Q05860 1466 aa33,11■■■□□ 2,89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr62Q3U3T8 1523 aa32,95■■■□□ 2,87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP32,94■■■□□ 2,86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Frmpd1A2AKB4 1549 aa32,94■■■□□ 2,86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa32,84■■■□□ 2,85
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP32,44■■■□□ 2,78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif15Q6P9L6 1387 aa32,4■■■□□ 2,78
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Camsap1A2AHC3 1581 aa32,24■■■□□ 2,75
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Npm2Q80W85 207 aa32,23■■■□□ 2,75
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Myt1lP97500 1187 aa32,13■■■□□ 2,73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PtprkP35822 1457 aa32,12■■■□□ 2,73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il27Q8K3I6 234 aa32,11■■■□□ 2,73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NrkQ9R0G8 1455 aa32,08■■■□□ 2,73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam135aQ6NS59 1506 aa32,08■■■□□ 2,73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc18Q640L5 1455 aa32,07■■■□□ 2,72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arhgap35Q91YM2 1499 aa32,02■■■□□ 2,72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Shroom4Q1W617 1475 aa32,02■■■□□ 2,72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grin2bQ01097 1482 aa31,97■■■□□ 2,71
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arap1Q4LDD4 1452 aa31,67■■■□□ 2,66
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP31,4■■■□□ 2,62
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP31,36■■■□□ 2,61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa31,36■■■□□ 2,61
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