RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000079702.3

Cbx1-202, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Lce1bQ9D149 137 aa7.36□□□□□ -1.23
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pmp2P24526 132 aa7.35□□□□□ -1.23
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cdk2ap2Q9CPY4 127 aa7.35□□□□□ -1.23
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pfn2Q9JJV2 140 aa7.35□□□□□ -1.23
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trav4-3A0A0B4J1K1 110 aa7.34□□□□□ -1.23
Cbx1-202ENSMUST00000079702 1700011M02RikB1AX35 88 aa7.34□□□□□ -1.23
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm20604F8WIA3 75 aa7.34□□□□□ -1.23
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Lect2O88803 151 aa7.34□□□□□ -1.23
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Try10Q792Z1 246 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ndufc2Q9CQ54 120 aa7.34□□□□□ -1.23
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ssbp1Q9CYR0 152 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm26727M0QWT1 121 aa7.33□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 S100a1P56565 94 aa7.33□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 SrarpQ3ULG3 163 aa7.33□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ndufv3Q8BK30 104 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dmac1Q9CQ00 111 aa7.33□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ly6hQ9WUC3 139 aa7.33□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Scgb1b15A0A087WP50 93 aa7.32□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Q8K1L6 76 aa7.32□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Smim29Q8R043 75 aa7.32□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tex54G3UW99 86 aa7.31□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 SnrpeP62305 92 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm20458E9PXJ7 78 aa7.3□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccdc179J3QM76 67 aa7.3□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cox7bP56393 80 aa7.3□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 1700010B08RikQ9DAI7 102 aa7.3□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm17521F6QAC8 156 aa7.29□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm9376G3UW68 176 aa7.29□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm10845Q3UNY9 185 aa7.29□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Defb39Q70KL3 74 aa7.29□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Plac1Q9JI83 173 aa7.29□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm29289A0A087WPY7 166 aa7.28□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Igkv3-7A0A0G2JE31 119 aa7.28□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm11011D3Z3L9 86 aa7.28□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm20726G3UX18 150 aa7.28□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm27235Q3UW50 83 aa7.28□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ube2aQ9Z255 152 aa7.28□□□□□ -1.24
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Scgb1b3J3QJY4 93 aa7.27□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tcl1b3P56842 122 aa7.27□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sostdc1Q9CQN4 206 aa7.27□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm10604Q3V0X7 143 aa7.26□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Lgals4Q8K419 326 aa7.26□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cend1Q9JKC6 149 aa7.26□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 HrnrQ8VHD8 2496 aa7.26□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trav4n-4A0A075B615 110 aa7.25□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Igkv8-18A0A0B4J1J3 123 aa7.25□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm45753A0A1C7CYU8 86 aa7.25□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm11020F6ZGD5 61 aa7.25□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slamf6Q9ET39 351 aa7.25□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm10577Q3UDV9 132 aa7.24□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm44965A0A0N4SVR3 59 aa7.23□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 H2al1nQ497L1 109 aa7.23□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Hist2h2beQ64524 126 aa7.23□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 AI606181Q8C7B9 129 aa7.23□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm10295Q8CCF3 114 aa7.23□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Igkv1-110A0A0B4J1I0 119 aa7.22□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 C920008G01RikA0A0B4J1N1 112 aa7.22□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Krtap3-1A2A591 98 aa7.22□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 BC048502Q80Y74 154 aa7.22□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Csdc2Q91YQ3 154 aa7.22□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Timm17bQ9Z0V7 172 aa7.22□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dpm2Q9Z324 84 aa7.22□□□□□ -1.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Hbb-bsA8DUK4 147 aa7.21□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm5153P01627 120 aa7.21□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Hbb-b1P02088 147 aa7.21□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cops9Q3U898 57 aa7.21□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Defa22Q8C1N8 93 aa7.21□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 4930415O20RikQ8CDT5 131 aa7.21□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Spata45Q9CVW4 97 aa7.21□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ociad2Q9D8W7 154 aa7.21□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Msrb1Q9JLC3 116 aa7.21□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trav4d-3A0A075B625 110 aa7.2□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Defb12Q8K4N3 78 aa7.2□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Phpt1Q9DAK9 124 aa7.2□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cd164Q9R0L9 197 aa7.2□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trappc1Q5NCF2 145 aa7.19□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 TeppQ6IMH0 216 aa7.19□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 LbhQ9CX60 105 aa7.19□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm9736A0A1W2P7N1 277 aa7.18□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 A030003K21RikA0A1Y7VIM3 128 aa7.18□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 119 aa7.17□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 2310034G01RikA0A286YDL3 209 aa7.17□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Glrp1E9Q9S8 174 aa7.17□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Scgb1b19F6WYW0 93 aa7.17□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm9805F6YK59 57 aa7.17□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mrpl52Q9D0Y8 121 aa7.17□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gnb1lQ9EQ15 326 aa7.17□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Lst1O08843 95 aa7.16□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Prm1P02319 51 aa7.16□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Lage3Q9CR70 148 aa7.16□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Wdr38Q9D994 303 aa7.16□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cited4Q9WUL8 182 aa7.16□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Znf706Q9D115 76 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Q9DAA7 145 aa7.15□□□□□ -1.26
Cbx1-202ENSMUST00000079702 MalO09198 153 aa7.14□□□□□ -1.27
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Smim1P0C8K7 78 aa7.14□□□□□ -1.27
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Odf3bQ5M8M2 238 aa7.14□□□□□ -1.27
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ush2AQ2QI47 5193 aa7.14□□□□□ -1.27
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm28230A0A0A0MQ91 144 aa7.13□□□□□ -1.27
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm10770F7D043 238 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 73.4 ms