Protein–RNA interactions for Protein: P56565

S100a1, Protein S100-A1, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100a1P56565 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
S100a1P56565 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
S100a1P56565 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
S100a1P56565 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
S100a1P56565 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
S100a1P56565 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
S100a1P56565 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
S100a1P56565 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
S100a1P56565 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
S100a1P56565 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
S100a1P56565 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
S100a1P56565 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
S100a1P56565 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
S100a1P56565 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
S100a1P56565 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
S100a1P56565 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
S100a1P56565 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
S100a1P56565 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
S100a1P56565 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
S100a1P56565 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
S100a1P56565 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
S100a1P56565 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
S100a1P56565 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
S100a1P56565 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
S100a1P56565 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
S100a1P56565 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
S100a1P56565 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
S100a1P56565 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
S100a1P56565 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
S100a1P56565 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
S100a1P56565 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
S100a1P56565 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
S100a1P56565 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
S100a1P56565 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
S100a1P56565 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
S100a1P56565 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
S100a1P56565 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
S100a1P56565 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
S100a1P56565 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
S100a1P56565 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
S100a1P56565 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
S100a1P56565 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
S100a1P56565 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
S100a1P56565 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
S100a1P56565 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
S100a1P56565 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
S100a1P56565 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
S100a1P56565 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
S100a1P56565 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
S100a1P56565 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
S100a1P56565 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
S100a1P56565 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
S100a1P56565 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
S100a1P56565 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
S100a1P56565 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
S100a1P56565 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
S100a1P56565 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
S100a1P56565 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
S100a1P56565 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
S100a1P56565 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
S100a1P56565 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S100a1P56565 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
S100a1P56565 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S100a1P56565 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
S100a1P56565 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S100a1P56565 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S100a1P56565 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S100a1P56565 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
S100a1P56565 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
S100a1P56565 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S100a1P56565 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
S100a1P56565 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S100a1P56565 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S100a1P56565 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
S100a1P56565 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S100a1P56565 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S100a1P56565 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S100a1P56565 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S100a1P56565 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S100a1P56565 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
S100a1P56565 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
S100a1P56565 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
S100a1P56565 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
S100a1P56565 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
S100a1P56565 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
S100a1P56565 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
S100a1P56565 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
S100a1P56565 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
S100a1P56565 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
S100a1P56565 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
S100a1P56565 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
S100a1P56565 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
S100a1P56565 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
S100a1P56565 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
S100a1P56565 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
S100a1P56565 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
S100a1P56565 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
S100a1P56565 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
S100a1P56565 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
S100a1P56565 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms