Protein–RNA interactions for Protein: A2A591

Krtap3-1, Keratin-associated protein 3-1, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap3-1A2A591 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC17,23■□□□□ 0,35
Krtap3-1A2A591 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0,31
Krtap3-1A2A591 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,22
Krtap3-1A2A591 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,43■□□□□ 0,22
Krtap3-1A2A591 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC15,91■□□□□ 0,14
Krtap3-1A2A591 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Krtap3-1A2A591 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,66■□□□□ 0,1
Krtap3-1A2A591 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Krtap3-1A2A591 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Krtap3-1A2A591 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
Krtap3-1A2A591 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC15,44■□□□□ 0,06
Krtap3-1A2A591 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,35■□□□□ 0,05
Krtap3-1A2A591 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,32■□□□□ 0,04
Krtap3-1A2A591 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC15,24■□□□□ 0,03
Krtap3-1A2A591 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,23■□□□□ 0,03
Krtap3-1A2A591 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,22■□□□□ 0,03
Krtap3-1A2A591 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,21■□□□□ 0,03
Krtap3-1A2A591 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC15,19■□□□□ 0,02
Krtap3-1A2A591 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,01□□□□□ -0,01
Krtap3-1A2A591 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,96□□□□□ -0,01
Krtap3-1A2A591 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,87□□□□□ -0,03
Krtap3-1A2A591 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,86□□□□□ -0,03
Krtap3-1A2A591 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,85□□□□□ -0,03
Krtap3-1A2A591 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,83□□□□□ -0,04
Krtap3-1A2A591 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC14,81□□□□□ -0,04
Krtap3-1A2A591 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,8□□□□□ -0,04
Krtap3-1A2A591 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,8□□□□□ -0,04
Krtap3-1A2A591 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC14,77□□□□□ -0,05
Krtap3-1A2A591 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,77□□□□□ -0,05
Krtap3-1A2A591 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,75□□□□□ -0,05
Krtap3-1A2A591 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,72□□□□□ -0,05
Krtap3-1A2A591 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,7□□□□□ -0,06
Krtap3-1A2A591 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC14,69□□□□□ -0,06
Krtap3-1A2A591 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,63□□□□□ -0,07
Krtap3-1A2A591 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC14,61□□□□□ -0,07
Krtap3-1A2A591 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,59□□□□□ -0,07
Krtap3-1A2A591 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC14,57□□□□□ -0,08
Krtap3-1A2A591 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14,56□□□□□ -0,08
Krtap3-1A2A591 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,52□□□□□ -0,09
Krtap3-1A2A591 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC14,44□□□□□ -0,1
Krtap3-1A2A591 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,44□□□□□ -0,1
Krtap3-1A2A591 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC14,43□□□□□ -0,1
Krtap3-1A2A591 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC14,43□□□□□ -0,1
Krtap3-1A2A591 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,42□□□□□ -0,1
Krtap3-1A2A591 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,4□□□□□ -0,1
Krtap3-1A2A591 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
Krtap3-1A2A591 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,11
Krtap3-1A2A591 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14,26□□□□□ -0,13
Krtap3-1A2A591 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,25□□□□□ -0,13
Krtap3-1A2A591 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC14,24□□□□□ -0,13
Krtap3-1A2A591 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC14,21□□□□□ -0,13
Krtap3-1A2A591 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14,2□□□□□ -0,14
Krtap3-1A2A591 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,18□□□□□ -0,14
Krtap3-1A2A591 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,14□□□□□ -0,15
Krtap3-1A2A591 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,11□□□□□ -0,15
Krtap3-1A2A591 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,11□□□□□ -0,15
Krtap3-1A2A591 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC14,11□□□□□ -0,15
Krtap3-1A2A591 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,08□□□□□ -0,15
Krtap3-1A2A591 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC14,05□□□□□ -0,16
Krtap3-1A2A591 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,04□□□□□ -0,16
Krtap3-1A2A591 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,03□□□□□ -0,16
Krtap3-1A2A591 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,03□□□□□ -0,16
Krtap3-1A2A591 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,02□□□□□ -0,17
Krtap3-1A2A591 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,01□□□□□ -0,17
Krtap3-1A2A591 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,01□□□□□ -0,17
Krtap3-1A2A591 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0,17
Krtap3-1A2A591 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,98□□□□□ -0,17
Krtap3-1A2A591 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,94□□□□□ -0,18
Krtap3-1A2A591 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,92□□□□□ -0,18
Krtap3-1A2A591 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,9□□□□□ -0,18
Krtap3-1A2A591 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13,9□□□□□ -0,19
Krtap3-1A2A591 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13,89□□□□□ -0,19
Krtap3-1A2A591 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,87□□□□□ -0,19
Krtap3-1A2A591 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13,87□□□□□ -0,19
Krtap3-1A2A591 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,82□□□□□ -0,2
Krtap3-1A2A591 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,76□□□□□ -0,21
Krtap3-1A2A591 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,73□□□□□ -0,21
Krtap3-1A2A591 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,72□□□□□ -0,21
Krtap3-1A2A591 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,71□□□□□ -0,21
Krtap3-1A2A591 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,71□□□□□ -0,22
Krtap3-1A2A591 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC13,7□□□□□ -0,22
Krtap3-1A2A591 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,68□□□□□ -0,22
Krtap3-1A2A591 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13,68□□□□□ -0,22
Krtap3-1A2A591 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13,66□□□□□ -0,22
Krtap3-1A2A591 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,64□□□□□ -0,23
Krtap3-1A2A591 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,63□□□□□ -0,23
Krtap3-1A2A591 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC13,63□□□□□ -0,23
Krtap3-1A2A591 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,62□□□□□ -0,23
Krtap3-1A2A591 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13,61□□□□□ -0,23
Krtap3-1A2A591 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC13,61□□□□□ -0,23
Krtap3-1A2A591 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,61□□□□□ -0,23
Krtap3-1A2A591 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,6□□□□□ -0,23
Krtap3-1A2A591 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,6□□□□□ -0,23
Krtap3-1A2A591 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,59□□□□□ -0,23
Krtap3-1A2A591 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,59□□□□□ -0,23
Krtap3-1A2A591 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,58□□□□□ -0,24
Krtap3-1A2A591 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,55□□□□□ -0,24
Krtap3-1A2A591 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,54□□□□□ -0,24
Krtap3-1A2A591 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC13,54□□□□□ -0,24
Krtap3-1A2A591 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,53□□□□□ -0,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,4 ms