Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B615

Trav4n-4, T cell receptor alpha variable 4D-4 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav4n-4A0A075B615 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Trav4n-4A0A075B615 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,2■■□□□ 1,3
Trav4n-4A0A075B615 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Trav4n-4A0A075B615 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Trav4n-4A0A075B615 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22,75■■□□□ 1,23
Trav4n-4A0A075B615 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Trav4n-4A0A075B615 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Trav4n-4A0A075B615 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Trav4n-4A0A075B615 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Trav4n-4A0A075B615 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Trav4n-4A0A075B615 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Trav4n-4A0A075B615 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Trav4n-4A0A075B615 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Trav4n-4A0A075B615 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Trav4n-4A0A075B615 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Trav4n-4A0A075B615 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Trav4n-4A0A075B615 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,28■■□□□ 1
Trav4n-4A0A075B615 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21,26■□□□□ 0,99
Trav4n-4A0A075B615 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Trav4n-4A0A075B615 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Trav4n-4A0A075B615 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Trav4n-4A0A075B615 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20,75■□□□□ 0,91
Trav4n-4A0A075B615 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Trav4n-4A0A075B615 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20,64■□□□□ 0,9
Trav4n-4A0A075B615 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Trav4n-4A0A075B615 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Trav4n-4A0A075B615 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Trav4n-4A0A075B615 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Trav4n-4A0A075B615 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Trav4n-4A0A075B615 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20,48■□□□□ 0,87
Trav4n-4A0A075B615 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Trav4n-4A0A075B615 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Trav4n-4A0A075B615 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Trav4n-4A0A075B615 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Trav4n-4A0A075B615 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,29■□□□□ 0,84
Trav4n-4A0A075B615 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20,26■□□□□ 0,83
Trav4n-4A0A075B615 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Trav4n-4A0A075B615 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Trav4n-4A0A075B615 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Trav4n-4A0A075B615 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Trav4n-4A0A075B615 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Trav4n-4A0A075B615 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,12■□□□□ 0,81
Trav4n-4A0A075B615 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Trav4n-4A0A075B615 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20,02■□□□□ 0,8
Trav4n-4A0A075B615 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,99■□□□□ 0,79
Trav4n-4A0A075B615 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Trav4n-4A0A075B615 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19,91■□□□□ 0,78
Trav4n-4A0A075B615 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19,9■□□□□ 0,78
Trav4n-4A0A075B615 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Trav4n-4A0A075B615 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Trav4n-4A0A075B615 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19,75■□□□□ 0,75
Trav4n-4A0A075B615 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Trav4n-4A0A075B615 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Trav4n-4A0A075B615 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19,7■□□□□ 0,74
Trav4n-4A0A075B615 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Trav4n-4A0A075B615 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Trav4n-4A0A075B615 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Trav4n-4A0A075B615 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,73
Trav4n-4A0A075B615 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19,64■□□□□ 0,73
Trav4n-4A0A075B615 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,73
Trav4n-4A0A075B615 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,63■□□□□ 0,73
Trav4n-4A0A075B615 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19,6■□□□□ 0,73
Trav4n-4A0A075B615 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,56■□□□□ 0,72
Trav4n-4A0A075B615 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Trav4n-4A0A075B615 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Trav4n-4A0A075B615 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Trav4n-4A0A075B615 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Trav4n-4A0A075B615 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,5■□□□□ 0,71
Trav4n-4A0A075B615 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,48■□□□□ 0,71
Trav4n-4A0A075B615 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
Trav4n-4A0A075B615 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
Trav4n-4A0A075B615 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Trav4n-4A0A075B615 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Trav4n-4A0A075B615 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Trav4n-4A0A075B615 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19,42■□□□□ 0,7
Trav4n-4A0A075B615 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,41■□□□□ 0,7
Trav4n-4A0A075B615 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19,38■□□□□ 0,69
Trav4n-4A0A075B615 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
Trav4n-4A0A075B615 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19,36■□□□□ 0,69
Trav4n-4A0A075B615 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19,36■□□□□ 0,69
Trav4n-4A0A075B615 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
Trav4n-4A0A075B615 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,33■□□□□ 0,69
Trav4n-4A0A075B615 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,29■□□□□ 0,68
Trav4n-4A0A075B615 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
Trav4n-4A0A075B615 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
Trav4n-4A0A075B615 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
Trav4n-4A0A075B615 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
Trav4n-4A0A075B615 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
Trav4n-4A0A075B615 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Trav4n-4A0A075B615 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Trav4n-4A0A075B615 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
Trav4n-4A0A075B615 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19,14■□□□□ 0,65
Trav4n-4A0A075B615 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Trav4n-4A0A075B615 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
Trav4n-4A0A075B615 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Trav4n-4A0A075B615 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Trav4n-4A0A075B615 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,02■□□□□ 0,64
Trav4n-4A0A075B615 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0,63
Trav4n-4A0A075B615 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Trav4n-4A0A075B615 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18,95■□□□□ 0,62
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