Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXZ4

Ighv1-62-2, Immunoglobulin heavy variable 1-62-2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22,89■■□□□ 1,25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,28■■□□□ 1,16
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,62■■□□□ 1,05
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21,47■■□□□ 1,03
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21,37■■□□□ 1,01
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,33■■□□□ 1,01
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,15■□□□□ 0,98
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20,69■□□□□ 0,9
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20,27■□□□□ 0,84
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,22■□□□□ 0,83
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20,17■□□□□ 0,82
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,08■□□□□ 0,8
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,07■□□□□ 0,8
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19,88■□□□□ 0,77
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19,69■□□□□ 0,74
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,74
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19,61■□□□□ 0,73
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,73
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Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19,56■□□□□ 0,72
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,55■□□□□ 0,72
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
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Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,52■□□□□ 0,72
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Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19,5■□□□□ 0,71
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,45■□□□□ 0,7
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