Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msrb1Q9JLC3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Msrb1Q9JLC3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msrb1Q9JLC3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msrb1Q9JLC3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Msrb1Q9JLC3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Msrb1Q9JLC3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msrb1Q9JLC3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msrb1Q9JLC3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msrb1Q9JLC3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msrb1Q9JLC3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msrb1Q9JLC3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Msrb1Q9JLC3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msrb1Q9JLC3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Msrb1Q9JLC3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Msrb1Q9JLC3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Msrb1Q9JLC3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msrb1Q9JLC3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msrb1Q9JLC3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msrb1Q9JLC3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Msrb1Q9JLC3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Msrb1Q9JLC3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msrb1Q9JLC3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msrb1Q9JLC3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msrb1Q9JLC3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msrb1Q9JLC3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msrb1Q9JLC3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msrb1Q9JLC3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msrb1Q9JLC3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msrb1Q9JLC3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msrb1Q9JLC3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msrb1Q9JLC3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Msrb1Q9JLC3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msrb1Q9JLC3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msrb1Q9JLC3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msrb1Q9JLC3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Msrb1Q9JLC3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msrb1Q9JLC3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msrb1Q9JLC3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msrb1Q9JLC3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msrb1Q9JLC3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Msrb1Q9JLC3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Msrb1Q9JLC3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msrb1Q9JLC3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msrb1Q9JLC3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msrb1Q9JLC3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msrb1Q9JLC3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msrb1Q9JLC3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msrb1Q9JLC3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msrb1Q9JLC3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Msrb1Q9JLC3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msrb1Q9JLC3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msrb1Q9JLC3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msrb1Q9JLC3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msrb1Q9JLC3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msrb1Q9JLC3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msrb1Q9JLC3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msrb1Q9JLC3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msrb1Q9JLC3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msrb1Q9JLC3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msrb1Q9JLC3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msrb1Q9JLC3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msrb1Q9JLC3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msrb1Q9JLC3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msrb1Q9JLC3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msrb1Q9JLC3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Msrb1Q9JLC3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msrb1Q9JLC3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msrb1Q9JLC3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msrb1Q9JLC3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msrb1Q9JLC3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Msrb1Q9JLC3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msrb1Q9JLC3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msrb1Q9JLC3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msrb1Q9JLC3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msrb1Q9JLC3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msrb1Q9JLC3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msrb1Q9JLC3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msrb1Q9JLC3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msrb1Q9JLC3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msrb1Q9JLC3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msrb1Q9JLC3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msrb1Q9JLC3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msrb1Q9JLC3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Msrb1Q9JLC3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msrb1Q9JLC3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msrb1Q9JLC3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msrb1Q9JLC3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msrb1Q9JLC3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msrb1Q9JLC3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msrb1Q9JLC3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msrb1Q9JLC3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msrb1Q9JLC3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msrb1Q9JLC3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msrb1Q9JLC3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msrb1Q9JLC3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msrb1Q9JLC3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msrb1Q9JLC3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msrb1Q9JLC3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Msrb1Q9JLC3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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