RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 BC025920Q3US60 128 aa7.61□□□□□ -1.19
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tln1P26039 2541 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
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Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 OxtP35454 125 aa7.6□□□□□ -1.19
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Flg2Q2VIS4 2362 aa7.6□□□□□ -1.19
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm28230A0A0A0MQ91 144 aa7.6□□□□□ -1.19
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sptbn4E9PX29 2561 aa7.6□□□□□ -1.19
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dscaml1Q4VA61 2053 aa7.59□□□□□ -1.19
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 4930524J08RikQ9CUJ5 163 aa7.59□□□□□ -1.19
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 A730009L09RikA0A1B0GS82 72 aa7.59□□□□□ -1.19
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Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10267M0QWD8 85 aa7.55□□□□□ -1.2
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10837Q3UTT8 145 aa7.55□□□□□ -1.2
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ttc28Q80XJ3 2450 aa7.55□□□□□ -1.2
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Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cd164Q9R0L9 197 aa7.54□□□□□ -1.2
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ndufs5Q99LY9 106 aa7.53□□□□□ -1.2
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm17606F6ZL36 78 aa7.53□□□□□ -1.2
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Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MobpQ9D2P8 170 aa7.53□□□□□ -1.2
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pkd1l2Q7TN88 2461 aa7.52□□□□□ -1.21
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 3110070M22RikQ9DAQ7 118 aa7.52□□□□□ -1.21
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Csdc2Q91YQ3 154 aa7.52□□□□□ -1.21
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Smr3aQ61900 147 aa7.52□□□□□ -1.21
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nav2E9Q842 2432 aa7.51□□□□□ -1.21
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ptpn13Q64512 2453 aa7.51□□□□□ -1.21
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rpl37aP61514 92 aa7.51□□□□□ -1.21
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P01819 144 aa7.5□□□□□ -1.21
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prol1E9PYQ4 312 aa7.5□□□□□ -1.21
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm3250E9Q1M3 230 aa7.49□□□□□ -1.21
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10570F6VB42 170 aa7.49□□□□□ -1.21
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 RetnlbQ99P86 105 aa7.48□□□□□ -1.21
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cox6a2P43023 97 aa7.48□□□□□ -1.21
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SetxA2AKX3 2646 aa7.47□□□□□ -1.21
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpr15lA0A0B4J1N3 78 aa7.47□□□□□ -1.21
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Phf5aP83870 110 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm27235Q3UW50 83 aa7.47□□□□□ -1.21
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Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Msrb1Q9JLC3 116 aa7.46□□□□□ -1.21
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 AplnQ9R0R4 77 aa7.45□□□□□ -1.22
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 H2al1kJ3QP08 105 aa7.45□□□□□ -1.22
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cdip1Q9DB75 208 aa7.44□□□□□ -1.22
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Elof1P60003 83 aa7.44□□□□□ -1.22
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ighv2-2A0A075B5P8 116 aa7.43□□□□□ -1.22
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ighv2-5A0A0A6YY69 116 aa7.43□□□□□ -1.22
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm21886J3QJU9 214 aa7.43□□□□□ -1.22
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P01821 116 aa7.43□□□□□ -1.22
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm11565A2A4M7 156 aa7.42□□□□□ -1.22
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Spink13Q3UTS8 97 aa7.41□□□□□ -1.22
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 TroQ6DIC6 2087 aa7.41□□□□□ -1.22
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mrpl34Q99N91 92 aa7.41□□□□□ -1.22
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 1700018G05RikA0A1B0GSI2 66 aa7.41□□□□□ -1.22
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Defb38Q7TNV7 63 aa7.41□□□□□ -1.22
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Golgb1E9PVZ8 3238 aa7.41□□□□□ -1.22
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SrcapA0A087WQ44 3271 aa7.41□□□□□ -1.22
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Reg3aO09037 175 aa7.41□□□□□ -1.22
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10772F7AIG4 85 aa7.4□□□□□ -1.23
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 6430550D23RikE9Q1X6 194 aa7.39□□□□□ -1.23
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10135F6TEE5 83 aa7.37□□□□□ -1.23
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Spaca4Q80ZQ0 127 aa7.37□□□□□ -1.23
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rps28P62858 69 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Arhgap32Q811P8 2089 aa7.36□□□□□ -1.23
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nav3Q80TN7 2359 aa7.35□□□□□ -1.23
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Defb37Q7TMD2 62 aa7.34□□□□□ -1.23
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zfp462B1AWL2 2495 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Defb50Q6TU36 73 aa7.34□□□□□ -1.23
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hivep3A2A884 2348 aa7.34□□□□□ -1.23
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 4930507D05RikQ8C9C9 103 aa7.34□□□□□ -1.24
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm5617Q91VN2 117 aa7.33□□□□□ -1.24
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Usp9xP70398 2559 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SnurfQ9WU12 71 aa7.33□□□□□ -1.24
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Igkv8-27A0A0G2JF28 120 aa7.32□□□□□ -1.24
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Piezo2Q8CD54 2822 aa7.3□□□□□ -1.24
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hcfc1Q61191 2045 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10160F6Y577 67 aa7.3□□□□□ -1.24
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sprr4Q8CGN8 76 aa7.3□□□□□ -1.24
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q8BGJ3 129 aa7.28□□□□□ -1.24
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10999F6Q4M4 69 aa7.28□□□□□ -1.24
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Spint4Q9D263 159 aa7.28□□□□□ -1.24
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Coa6Q8BGD8 79 aa7.27□□□□□ -1.24
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 A930002H24RikQ8C8Y3 163 aa7.27□□□□□ -1.25
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Defb45Q3V490 66 aa7.27□□□□□ -1.25
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Krtap11-1E9Q2E9 183 aa7.27□□□□□ -1.25
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sostdc1Q9CQN4 206 aa7.27□□□□□ -1.25
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 4930518I15RikQ3V2W7 57 aa7.26□□□□□ -1.25
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lypd5Q9D7Z7 256 aa7.26□□□□□ -1.25
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm44790A0A0N4SV91 103 aa7.26□□□□□ -1.25
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