Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD8

Coa6, Cytochrome c oxidase assembly factor 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coa6Q8BGD8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Coa6Q8BGD8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Coa6Q8BGD8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,32■□□□□ 0,68
Coa6Q8BGD8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,08■□□□□ 0,65
Coa6Q8BGD8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC18,93■□□□□ 0,62
Coa6Q8BGD8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Coa6Q8BGD8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,25■□□□□ 0,51
Coa6Q8BGD8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Coa6Q8BGD8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Coa6Q8BGD8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Coa6Q8BGD8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0,47
Coa6Q8BGD8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Coa6Q8BGD8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Coa6Q8BGD8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Coa6Q8BGD8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Coa6Q8BGD8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Coa6Q8BGD8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Coa6Q8BGD8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Coa6Q8BGD8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Coa6Q8BGD8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
Coa6Q8BGD8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17,63■□□□□ 0,41
Coa6Q8BGD8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,62■□□□□ 0,41
Coa6Q8BGD8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,6■□□□□ 0,41
Coa6Q8BGD8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC17,57■□□□□ 0,4
Coa6Q8BGD8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,4
Coa6Q8BGD8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,28■□□□□ 0,36
Coa6Q8BGD8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,36
Coa6Q8BGD8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,36
Coa6Q8BGD8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC17,21■□□□□ 0,35
Coa6Q8BGD8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
Coa6Q8BGD8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17,14■□□□□ 0,33
Coa6Q8BGD8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0,31
Coa6Q8BGD8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Coa6Q8BGD8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC16,95■□□□□ 0,3
Coa6Q8BGD8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,94■□□□□ 0,3
Coa6Q8BGD8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,94■□□□□ 0,3
Coa6Q8BGD8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Coa6Q8BGD8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
Coa6Q8BGD8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
Coa6Q8BGD8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,86■□□□□ 0,29
Coa6Q8BGD8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Coa6Q8BGD8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,28
Coa6Q8BGD8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,78■□□□□ 0,28
Coa6Q8BGD8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,27
Coa6Q8BGD8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Coa6Q8BGD8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Coa6Q8BGD8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Coa6Q8BGD8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16,72■□□□□ 0,27
Coa6Q8BGD8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,27
Coa6Q8BGD8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC16,66■□□□□ 0,26
Coa6Q8BGD8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC16,65■□□□□ 0,26
Coa6Q8BGD8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Coa6Q8BGD8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
Coa6Q8BGD8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Coa6Q8BGD8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
Coa6Q8BGD8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,55■□□□□ 0,24
Coa6Q8BGD8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Coa6Q8BGD8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC16,54■□□□□ 0,24
Coa6Q8BGD8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC16,54■□□□□ 0,24
Coa6Q8BGD8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
Coa6Q8BGD8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC16,5■□□□□ 0,23
Coa6Q8BGD8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Coa6Q8BGD8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Coa6Q8BGD8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Coa6Q8BGD8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC16,44■□□□□ 0,22
Coa6Q8BGD8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
Coa6Q8BGD8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,36■□□□□ 0,21
Coa6Q8BGD8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC16,34■□□□□ 0,21
Coa6Q8BGD8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
Coa6Q8BGD8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Coa6Q8BGD8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,31■□□□□ 0,2
Coa6Q8BGD8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Coa6Q8BGD8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Coa6Q8BGD8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Coa6Q8BGD8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Coa6Q8BGD8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Coa6Q8BGD8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,21■□□□□ 0,19
Coa6Q8BGD8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,21■□□□□ 0,19
Coa6Q8BGD8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16,2■□□□□ 0,18
Coa6Q8BGD8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16,2■□□□□ 0,18
Coa6Q8BGD8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Coa6Q8BGD8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Coa6Q8BGD8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
Coa6Q8BGD8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Coa6Q8BGD8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Coa6Q8BGD8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Coa6Q8BGD8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Coa6Q8BGD8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Coa6Q8BGD8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Coa6Q8BGD8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Coa6Q8BGD8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16,04■□□□□ 0,16
Coa6Q8BGD8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Coa6Q8BGD8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Coa6Q8BGD8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC16,03■□□□□ 0,16
Coa6Q8BGD8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,15
Coa6Q8BGD8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Coa6Q8BGD8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Coa6Q8BGD8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Coa6Q8BGD8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Coa6Q8BGD8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms