Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7N2

Krtap26-1, Keratin-associated protein 26-1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap26-1Q9D7N2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,48■■□□□ 1,99
Krtap26-1Q9D7N2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Krtap26-1Q9D7N2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Krtap26-1Q9D7N2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Krtap26-1Q9D7N2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Krtap26-1Q9D7N2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Krtap26-1Q9D7N2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,47■■□□□ 1,51
Krtap26-1Q9D7N2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,03■■□□□ 1,44
Krtap26-1Q9D7N2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Krtap26-1Q9D7N2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24■■□□□ 1,43
Krtap26-1Q9D7N2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,65■■□□□ 1,38
Krtap26-1Q9D7N2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Krtap26-1Q9D7N2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Krtap26-1Q9D7N2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,59■■□□□ 1,37
Krtap26-1Q9D7N2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Krtap26-1Q9D7N2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Krtap26-1Q9D7N2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Krtap26-1Q9D7N2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Krtap26-1Q9D7N2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Krtap26-1Q9D7N2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Krtap26-1Q9D7N2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Krtap26-1Q9D7N2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Krtap26-1Q9D7N2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,04■■□□□ 1,28
Krtap26-1Q9D7N2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,03■■□□□ 1,28
Krtap26-1Q9D7N2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Krtap26-1Q9D7N2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Krtap26-1Q9D7N2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Krtap26-1Q9D7N2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Krtap26-1Q9D7N2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Krtap26-1Q9D7N2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Krtap26-1Q9D7N2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,75■■□□□ 1,23
Krtap26-1Q9D7N2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Krtap26-1Q9D7N2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Krtap26-1Q9D7N2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Krtap26-1Q9D7N2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Krtap26-1Q9D7N2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Krtap26-1Q9D7N2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Krtap26-1Q9D7N2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,4■■□□□ 1,18
Krtap26-1Q9D7N2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,38■■□□□ 1,17
Krtap26-1Q9D7N2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Krtap26-1Q9D7N2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Krtap26-1Q9D7N2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Krtap26-1Q9D7N2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Krtap26-1Q9D7N2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Krtap26-1Q9D7N2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,11■■□□□ 1,13
Krtap26-1Q9D7N2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Krtap26-1Q9D7N2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Krtap26-1Q9D7N2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Krtap26-1Q9D7N2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Krtap26-1Q9D7N2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Krtap26-1Q9D7N2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Krtap26-1Q9D7N2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Krtap26-1Q9D7N2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Krtap26-1Q9D7N2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Krtap26-1Q9D7N2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Krtap26-1Q9D7N2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Krtap26-1Q9D7N2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Krtap26-1Q9D7N2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Krtap26-1Q9D7N2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Krtap26-1Q9D7N2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,62■■□□□ 1,05
Krtap26-1Q9D7N2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Krtap26-1Q9D7N2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,58■■□□□ 1,04
Krtap26-1Q9D7N2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Krtap26-1Q9D7N2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Krtap26-1Q9D7N2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,55■■□□□ 1,04
Krtap26-1Q9D7N2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21,55■■□□□ 1,04
Krtap26-1Q9D7N2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,53■■□□□ 1,04
Krtap26-1Q9D7N2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,51■■□□□ 1,03
Krtap26-1Q9D7N2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Krtap26-1Q9D7N2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Krtap26-1Q9D7N2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Krtap26-1Q9D7N2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Krtap26-1Q9D7N2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,35■■□□□ 1,01
Krtap26-1Q9D7N2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Krtap26-1Q9D7N2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Krtap26-1Q9D7N2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Krtap26-1Q9D7N2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Krtap26-1Q9D7N2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,22■□□□□ 0,99
Krtap26-1Q9D7N2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Krtap26-1Q9D7N2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Krtap26-1Q9D7N2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Krtap26-1Q9D7N2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Krtap26-1Q9D7N2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Krtap26-1Q9D7N2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Krtap26-1Q9D7N2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Krtap26-1Q9D7N2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Krtap26-1Q9D7N2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Krtap26-1Q9D7N2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Krtap26-1Q9D7N2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Krtap26-1Q9D7N2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Krtap26-1Q9D7N2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Krtap26-1Q9D7N2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Krtap26-1Q9D7N2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Krtap26-1Q9D7N2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Krtap26-1Q9D7N2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Krtap26-1Q9D7N2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Krtap26-1Q9D7N2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Krtap26-1Q9D7N2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Krtap26-1Q9D7N2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20,87■□□□□ 0,93
Krtap26-1Q9D7N2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,1 ms