Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7N2

Krtap26-1, Keratin-associated protein 26-1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap26-1Q9D7N2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Krtap26-1Q9D7N2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krtap26-1Q9D7N2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krtap26-1Q9D7N2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krtap26-1Q9D7N2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krtap26-1Q9D7N2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krtap26-1Q9D7N2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Krtap26-1Q9D7N2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Krtap26-1Q9D7N2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krtap26-1Q9D7N2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Krtap26-1Q9D7N2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Krtap26-1Q9D7N2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krtap26-1Q9D7N2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krtap26-1Q9D7N2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Krtap26-1Q9D7N2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krtap26-1Q9D7N2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krtap26-1Q9D7N2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krtap26-1Q9D7N2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krtap26-1Q9D7N2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krtap26-1Q9D7N2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krtap26-1Q9D7N2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krtap26-1Q9D7N2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krtap26-1Q9D7N2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Krtap26-1Q9D7N2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Krtap26-1Q9D7N2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krtap26-1Q9D7N2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krtap26-1Q9D7N2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krtap26-1Q9D7N2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krtap26-1Q9D7N2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krtap26-1Q9D7N2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krtap26-1Q9D7N2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krtap26-1Q9D7N2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krtap26-1Q9D7N2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krtap26-1Q9D7N2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krtap26-1Q9D7N2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krtap26-1Q9D7N2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krtap26-1Q9D7N2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krtap26-1Q9D7N2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Krtap26-1Q9D7N2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krtap26-1Q9D7N2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krtap26-1Q9D7N2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krtap26-1Q9D7N2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krtap26-1Q9D7N2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krtap26-1Q9D7N2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krtap26-1Q9D7N2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Krtap26-1Q9D7N2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krtap26-1Q9D7N2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krtap26-1Q9D7N2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krtap26-1Q9D7N2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krtap26-1Q9D7N2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krtap26-1Q9D7N2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krtap26-1Q9D7N2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krtap26-1Q9D7N2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krtap26-1Q9D7N2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krtap26-1Q9D7N2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krtap26-1Q9D7N2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krtap26-1Q9D7N2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krtap26-1Q9D7N2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krtap26-1Q9D7N2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krtap26-1Q9D7N2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Krtap26-1Q9D7N2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krtap26-1Q9D7N2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krtap26-1Q9D7N2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krtap26-1Q9D7N2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krtap26-1Q9D7N2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Krtap26-1Q9D7N2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Krtap26-1Q9D7N2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Krtap26-1Q9D7N2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krtap26-1Q9D7N2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krtap26-1Q9D7N2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krtap26-1Q9D7N2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krtap26-1Q9D7N2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krtap26-1Q9D7N2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krtap26-1Q9D7N2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krtap26-1Q9D7N2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krtap26-1Q9D7N2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krtap26-1Q9D7N2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krtap26-1Q9D7N2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krtap26-1Q9D7N2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krtap26-1Q9D7N2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krtap26-1Q9D7N2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krtap26-1Q9D7N2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krtap26-1Q9D7N2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krtap26-1Q9D7N2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krtap26-1Q9D7N2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krtap26-1Q9D7N2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krtap26-1Q9D7N2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krtap26-1Q9D7N2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krtap26-1Q9D7N2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krtap26-1Q9D7N2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krtap26-1Q9D7N2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krtap26-1Q9D7N2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krtap26-1Q9D7N2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krtap26-1Q9D7N2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krtap26-1Q9D7N2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krtap26-1Q9D7N2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krtap26-1Q9D7N2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krtap26-1Q9D7N2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krtap26-1Q9D7N2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Krtap26-1Q9D7N2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms