Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps28P62858 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps28P62858 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps28P62858 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps28P62858 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rps28P62858 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rps28P62858 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps28P62858 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps28P62858 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps28P62858 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps28P62858 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps28P62858 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps28P62858 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps28P62858 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps28P62858 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps28P62858 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps28P62858 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps28P62858 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps28P62858 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps28P62858 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps28P62858 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps28P62858 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps28P62858 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps28P62858 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps28P62858 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps28P62858 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps28P62858 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps28P62858 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps28P62858 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps28P62858 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps28P62858 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps28P62858 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps28P62858 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps28P62858 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps28P62858 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps28P62858 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps28P62858 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps28P62858 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps28P62858 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps28P62858 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps28P62858 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps28P62858 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps28P62858 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps28P62858 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps28P62858 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps28P62858 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps28P62858 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps28P62858 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps28P62858 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps28P62858 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps28P62858 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps28P62858 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps28P62858 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps28P62858 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps28P62858 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps28P62858 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps28P62858 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps28P62858 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps28P62858 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps28P62858 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps28P62858 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps28P62858 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps28P62858 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps28P62858 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps28P62858 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps28P62858 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps28P62858 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps28P62858 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps28P62858 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps28P62858 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps28P62858 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps28P62858 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps28P62858 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps28P62858 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps28P62858 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps28P62858 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps28P62858 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps28P62858 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps28P62858 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps28P62858 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps28P62858 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps28P62858 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps28P62858 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps28P62858 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps28P62858 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps28P62858 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps28P62858 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps28P62858 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps28P62858 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps28P62858 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps28P62858 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps28P62858 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps28P62858 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps28P62858 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps28P62858 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps28P62858 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps28P62858 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps28P62858 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps28P62858 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps28P62858 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms