Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,41■■■■□ 3,42
Ptpn13Q64512 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Ptpn13Q64512 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Ptpn13Q64512 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,05■■■□□ 2,72
Ptpn13Q64512 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,85■■■□□ 2,53
Ptpn13Q64512 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Ptpn13Q64512 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Ptpn13Q64512 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Ptpn13Q64512 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Ptpn13Q64512 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Ptpn13Q64512 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,07■■■□□ 2,4
Ptpn13Q64512 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Ptpn13Q64512 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ptpn13Q64512 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ptpn13Q64512 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Ptpn13Q64512 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ptpn13Q64512 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Ptpn13Q64512 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,14■■■□□ 2,25
Ptpn13Q64512 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Ptpn13Q64512 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ptpn13Q64512 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Ptpn13Q64512 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Ptpn13Q64512 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ptpn13Q64512 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ptpn13Q64512 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Ptpn13Q64512 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
Ptpn13Q64512 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Ptpn13Q64512 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ptpn13Q64512 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Ptpn13Q64512 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,83■■■□□ 2,05
Ptpn13Q64512 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Ptpn13Q64512 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ptpn13Q64512 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Ptpn13Q64512 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,52■■■□□ 2
Ptpn13Q64512 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Ptpn13Q64512 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ptpn13Q64512 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Ptpn13Q64512 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ptpn13Q64512 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ptpn13Q64512 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ptpn13Q64512 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Ptpn13Q64512 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Ptpn13Q64512 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,93
Ptpn13Q64512 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Ptpn13Q64512 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Ptpn13Q64512 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ptpn13Q64512 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ptpn13Q64512 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ptpn13Q64512 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ptpn13Q64512 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ptpn13Q64512 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ptpn13Q64512 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,82■■□□□ 1,88
Ptpn13Q64512 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ptpn13Q64512 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ptpn13Q64512 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Ptpn13Q64512 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Ptpn13Q64512 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ptpn13Q64512 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Ptpn13Q64512 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,61■■□□□ 1,85
Ptpn13Q64512 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ptpn13Q64512 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,55■■□□□ 1,84
Ptpn13Q64512 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Ptpn13Q64512 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Ptpn13Q64512 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ptpn13Q64512 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ptpn13Q64512 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Ptpn13Q64512 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Ptpn13Q64512 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,33■■□□□ 1,81
Ptpn13Q64512 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Ptpn13Q64512 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Ptpn13Q64512 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
Ptpn13Q64512 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26,23■■□□□ 1,79
Ptpn13Q64512 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Ptpn13Q64512 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Ptpn13Q64512 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Ptpn13Q64512 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Ptpn13Q64512 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Ptpn13Q64512 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Ptpn13Q64512 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Ptpn13Q64512 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Ptpn13Q64512 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,99■■□□□ 1,75
Ptpn13Q64512 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Ptpn13Q64512 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Ptpn13Q64512 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Ptpn13Q64512 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Ptpn13Q64512 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Ptpn13Q64512 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,89■■□□□ 1,74
Ptpn13Q64512 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Ptpn13Q64512 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Ptpn13Q64512 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Ptpn13Q64512 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Ptpn13Q64512 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Ptpn13Q64512 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Ptpn13Q64512 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Ptpn13Q64512 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Ptpn13Q64512 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ptpn13Q64512 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ptpn13Q64512 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ptpn13Q64512 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
Ptpn13Q64512 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
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