Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Ptpn13Q64512 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ptpn13Q64512 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ptpn13Q64512 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Ptpn13Q64512 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Ptpn13Q64512 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ptpn13Q64512 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ptpn13Q64512 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ptpn13Q64512 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ptpn13Q64512 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Ptpn13Q64512 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Ptpn13Q64512 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Ptpn13Q64512 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ptpn13Q64512 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ptpn13Q64512 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ptpn13Q64512 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ptpn13Q64512 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ptpn13Q64512 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ptpn13Q64512 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ptpn13Q64512 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ptpn13Q64512 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ptpn13Q64512 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ptpn13Q64512 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ptpn13Q64512 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ptpn13Q64512 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ptpn13Q64512 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ptpn13Q64512 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ptpn13Q64512 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ptpn13Q64512 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ptpn13Q64512 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ptpn13Q64512 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ptpn13Q64512 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ptpn13Q64512 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ptpn13Q64512 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ptpn13Q64512 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ptpn13Q64512 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ptpn13Q64512 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ptpn13Q64512 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ptpn13Q64512 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ptpn13Q64512 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ptpn13Q64512 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ptpn13Q64512 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ptpn13Q64512 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ptpn13Q64512 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ptpn13Q64512 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ptpn13Q64512 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ptpn13Q64512 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ptpn13Q64512 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ptpn13Q64512 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ptpn13Q64512 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ptpn13Q64512 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ptpn13Q64512 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ptpn13Q64512 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ptpn13Q64512 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ptpn13Q64512 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ptpn13Q64512 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ptpn13Q64512 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ptpn13Q64512 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ptpn13Q64512 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ptpn13Q64512 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ptpn13Q64512 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ptpn13Q64512 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptpn13Q64512 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpn13Q64512 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptpn13Q64512 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptpn13Q64512 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ptpn13Q64512 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpn13Q64512 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpn13Q64512 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ptpn13Q64512 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ptpn13Q64512 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ptpn13Q64512 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptpn13Q64512 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ptpn13Q64512 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptpn13Q64512 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ptpn13Q64512 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptpn13Q64512 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptpn13Q64512 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptpn13Q64512 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ptpn13Q64512 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ptpn13Q64512 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ptpn13Q64512 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ptpn13Q64512 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ptpn13Q64512 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptpn13Q64512 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpn13Q64512 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptpn13Q64512 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptpn13Q64512 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ptpn13Q64512 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptpn13Q64512 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptpn13Q64512 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptpn13Q64512 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ptpn13Q64512 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ptpn13Q64512 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ptpn13Q64512 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ptpn13Q64512 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ptpn13Q64512 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ptpn13Q64512 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptpn13Q64512 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptpn13Q64512 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms