Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0R4

Apln, Apelin, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplnQ9R0R4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,21■■□□□ 1,79
AplnQ9R0R4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
AplnQ9R0R4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
AplnQ9R0R4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
AplnQ9R0R4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,02■■□□□ 1,28
AplnQ9R0R4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22,65■■□□□ 1,22
AplnQ9R0R4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
AplnQ9R0R4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,53■■□□□ 1,2
AplnQ9R0R4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,33■■□□□ 1,17
AplnQ9R0R4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
AplnQ9R0R4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
AplnQ9R0R4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
AplnQ9R0R4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,91■■□□□ 1,1
AplnQ9R0R4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
AplnQ9R0R4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
AplnQ9R0R4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21,54■■□□□ 1,04
AplnQ9R0R4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
AplnQ9R0R4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
AplnQ9R0R4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
AplnQ9R0R4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
AplnQ9R0R4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21,28■■□□□ 1
AplnQ9R0R4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21,23■□□□□ 0,99
AplnQ9R0R4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
AplnQ9R0R4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
AplnQ9R0R4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
AplnQ9R0R4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21,14■□□□□ 0,97
AplnQ9R0R4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
AplnQ9R0R4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,05■□□□□ 0,96
AplnQ9R0R4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
AplnQ9R0R4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20,98■□□□□ 0,95
AplnQ9R0R4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
AplnQ9R0R4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
AplnQ9R0R4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
AplnQ9R0R4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
AplnQ9R0R4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20,71■□□□□ 0,91
AplnQ9R0R4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
AplnQ9R0R4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20,66■□□□□ 0,9
AplnQ9R0R4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20,64■□□□□ 0,89
AplnQ9R0R4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
AplnQ9R0R4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
AplnQ9R0R4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
AplnQ9R0R4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
AplnQ9R0R4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
AplnQ9R0R4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,34■□□□□ 0,85
AplnQ9R0R4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
AplnQ9R0R4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,26■□□□□ 0,83
AplnQ9R0R4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
AplnQ9R0R4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
AplnQ9R0R4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20,23■□□□□ 0,83
AplnQ9R0R4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20,19■□□□□ 0,82
AplnQ9R0R4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20,16■□□□□ 0,82
AplnQ9R0R4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
AplnQ9R0R4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
AplnQ9R0R4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20,03■□□□□ 0,8
AplnQ9R0R4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
AplnQ9R0R4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
AplnQ9R0R4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19,99■□□□□ 0,79
AplnQ9R0R4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19,98■□□□□ 0,79
AplnQ9R0R4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,94■□□□□ 0,78
AplnQ9R0R4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
AplnQ9R0R4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
AplnQ9R0R4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,87■□□□□ 0,77
AplnQ9R0R4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19,87■□□□□ 0,77
AplnQ9R0R4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
AplnQ9R0R4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
AplnQ9R0R4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
AplnQ9R0R4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
AplnQ9R0R4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
AplnQ9R0R4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
AplnQ9R0R4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
AplnQ9R0R4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19,77■□□□□ 0,76
AplnQ9R0R4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
AplnQ9R0R4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19,75■□□□□ 0,75
AplnQ9R0R4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19,73■□□□□ 0,75
AplnQ9R0R4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
AplnQ9R0R4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
AplnQ9R0R4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19,68■□□□□ 0,74
AplnQ9R0R4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19,66■□□□□ 0,74
AplnQ9R0R4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
AplnQ9R0R4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19,63■□□□□ 0,73
AplnQ9R0R4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,72
AplnQ9R0R4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,72
AplnQ9R0R4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19,57■□□□□ 0,72
AplnQ9R0R4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19,53■□□□□ 0,72
AplnQ9R0R4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
AplnQ9R0R4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19,47■□□□□ 0,71
AplnQ9R0R4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
AplnQ9R0R4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
AplnQ9R0R4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
AplnQ9R0R4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19,42■□□□□ 0,7
AplnQ9R0R4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19,38■□□□□ 0,69
AplnQ9R0R4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
AplnQ9R0R4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
AplnQ9R0R4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
AplnQ9R0R4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,33■□□□□ 0,69
AplnQ9R0R4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19,32■□□□□ 0,68
AplnQ9R0R4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
AplnQ9R0R4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19,27■□□□□ 0,68
AplnQ9R0R4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
AplnQ9R0R4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,1 ms