Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,53■■■■□ 3,44
Pkd1l2Q7TN88 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Pkd1l2Q7TN88 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Pkd1l2Q7TN88 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,06■■■□□ 2,72
Pkd1l2Q7TN88 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,17■■■□□ 2,58
Pkd1l2Q7TN88 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Pkd1l2Q7TN88 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Pkd1l2Q7TN88 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Pkd1l2Q7TN88 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,46■■■□□ 2,47
Pkd1l2Q7TN88 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Pkd1l2Q7TN88 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,25■■■□□ 2,43
Pkd1l2Q7TN88 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
Pkd1l2Q7TN88 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Pkd1l2Q7TN88 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Pkd1l2Q7TN88 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Pkd1l2Q7TN88 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Pkd1l2Q7TN88 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Pkd1l2Q7TN88 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Pkd1l2Q7TN88 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Pkd1l2Q7TN88 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
Pkd1l2Q7TN88 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Pkd1l2Q7TN88 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Pkd1l2Q7TN88 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Pkd1l2Q7TN88 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Pkd1l2Q7TN88 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Pkd1l2Q7TN88 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Pkd1l2Q7TN88 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Pkd1l2Q7TN88 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Pkd1l2Q7TN88 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Pkd1l2Q7TN88 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Pkd1l2Q7TN88 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
Pkd1l2Q7TN88 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Pkd1l2Q7TN88 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Pkd1l2Q7TN88 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Pkd1l2Q7TN88 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Pkd1l2Q7TN88 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
Pkd1l2Q7TN88 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Pkd1l2Q7TN88 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Pkd1l2Q7TN88 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Pkd1l2Q7TN88 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Pkd1l2Q7TN88 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,48■■□□□ 1,99
Pkd1l2Q7TN88 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Pkd1l2Q7TN88 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Pkd1l2Q7TN88 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Pkd1l2Q7TN88 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Pkd1l2Q7TN88 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Pkd1l2Q7TN88 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,31■■□□□ 1,96
Pkd1l2Q7TN88 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Pkd1l2Q7TN88 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Pkd1l2Q7TN88 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Pkd1l2Q7TN88 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,13■■□□□ 1,93
Pkd1l2Q7TN88 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Pkd1l2Q7TN88 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Pkd1l2Q7TN88 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Pkd1l2Q7TN88 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Pkd1l2Q7TN88 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Pkd1l2Q7TN88 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Pkd1l2Q7TN88 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Pkd1l2Q7TN88 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Pkd1l2Q7TN88 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Pkd1l2Q7TN88 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Pkd1l2Q7TN88 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Pkd1l2Q7TN88 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Pkd1l2Q7TN88 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Pkd1l2Q7TN88 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Pkd1l2Q7TN88 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,5■■□□□ 1,83
Pkd1l2Q7TN88 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Pkd1l2Q7TN88 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,45■■□□□ 1,82
Pkd1l2Q7TN88 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Pkd1l2Q7TN88 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Pkd1l2Q7TN88 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Pkd1l2Q7TN88 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Pkd1l2Q7TN88 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Pkd1l2Q7TN88 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Pkd1l2Q7TN88 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Pkd1l2Q7TN88 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Pkd1l2Q7TN88 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Pkd1l2Q7TN88 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Pkd1l2Q7TN88 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Pkd1l2Q7TN88 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26,14■■□□□ 1,77
Pkd1l2Q7TN88 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Pkd1l2Q7TN88 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Pkd1l2Q7TN88 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Pkd1l2Q7TN88 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Pkd1l2Q7TN88 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26,05■■□□□ 1,76
Pkd1l2Q7TN88 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Pkd1l2Q7TN88 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Pkd1l2Q7TN88 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Pkd1l2Q7TN88 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,99■■□□□ 1,75
Pkd1l2Q7TN88 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Pkd1l2Q7TN88 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Pkd1l2Q7TN88 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Pkd1l2Q7TN88 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Pkd1l2Q7TN88 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Pkd1l2Q7TN88 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Pkd1l2Q7TN88 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Pkd1l2Q7TN88 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Pkd1l2Q7TN88 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Pkd1l2Q7TN88 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Pkd1l2Q7TN88 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,2 ms