Protein–RNA interactions for Protein: P60003

Elof1, Transcription elongation factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elof1P60003 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Elof1P60003 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,25■□□□□ 0,99
Elof1P60003 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21,21■□□□□ 0,99
Elof1P60003 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Elof1P60003 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20,66■□□□□ 0,9
Elof1P60003 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Elof1P60003 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Elof1P60003 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Elof1P60003 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Elof1P60003 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Elof1P60003 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Elof1P60003 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Elof1P60003 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Elof1P60003 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,42■□□□□ 0,7
Elof1P60003 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19,42■□□□□ 0,7
Elof1P60003 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Elof1P60003 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,34■□□□□ 0,69
Elof1P60003 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19,27■□□□□ 0,68
Elof1P60003 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Elof1P60003 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
Elof1P60003 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
Elof1P60003 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,16■□□□□ 0,66
Elof1P60003 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Elof1P60003 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19,12■□□□□ 0,65
Elof1P60003 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Elof1P60003 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC18,95■□□□□ 0,62
Elof1P60003 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Elof1P60003 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC18,83■□□□□ 0,6
Elof1P60003 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Elof1P60003 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18,79■□□□□ 0,6
Elof1P60003 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18,77■□□□□ 0,6
Elof1P60003 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
Elof1P60003 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Elof1P60003 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
Elof1P60003 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
Elof1P60003 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18,66■□□□□ 0,58
Elof1P60003 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,58■□□□□ 0,57
Elof1P60003 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,58■□□□□ 0,57
Elof1P60003 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,54■□□□□ 0,56
Elof1P60003 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18,53■□□□□ 0,56
Elof1P60003 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18,53■□□□□ 0,56
Elof1P60003 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,5■□□□□ 0,55
Elof1P60003 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18,47■□□□□ 0,55
Elof1P60003 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,46■□□□□ 0,55
Elof1P60003 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,43■□□□□ 0,54
Elof1P60003 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,42■□□□□ 0,54
Elof1P60003 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,53
Elof1P60003 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
Elof1P60003 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,53
Elof1P60003 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,33■□□□□ 0,52
Elof1P60003 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
Elof1P60003 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,26■□□□□ 0,51
Elof1P60003 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Elof1P60003 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Elof1P60003 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
Elof1P60003 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
Elof1P60003 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Elof1P60003 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18,04■□□□□ 0,48
Elof1P60003 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18,03■□□□□ 0,48
Elof1P60003 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,01■□□□□ 0,47
Elof1P60003 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Elof1P60003 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Elof1P60003 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Elof1P60003 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Elof1P60003 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Elof1P60003 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Elof1P60003 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,89■□□□□ 0,45
Elof1P60003 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Elof1P60003 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Elof1P60003 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17,85■□□□□ 0,45
Elof1P60003 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Elof1P60003 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Elof1P60003 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Elof1P60003 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,76■□□□□ 0,43
Elof1P60003 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17,76■□□□□ 0,43
Elof1P60003 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Elof1P60003 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Elof1P60003 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Elof1P60003 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Elof1P60003 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC17,68■□□□□ 0,42
Elof1P60003 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17,68■□□□□ 0,42
Elof1P60003 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17,66■□□□□ 0,42
Elof1P60003 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17,63■□□□□ 0,41
Elof1P60003 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17,61■□□□□ 0,41
Elof1P60003 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17,6■□□□□ 0,41
Elof1P60003 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
Elof1P60003 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17,58■□□□□ 0,41
Elof1P60003 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Elof1P60003 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Elof1P60003 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,56■□□□□ 0,4
Elof1P60003 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
Elof1P60003 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,54■□□□□ 0,4
Elof1P60003 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,54■□□□□ 0,4
Elof1P60003 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Elof1P60003 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Elof1P60003 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Elof1P60003 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Elof1P60003 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,38
Elof1P60003 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Elof1P60003 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms