Protein–RNA interactions for Protein: P04345

Cryga, Gamma-crystallin A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygaP04345 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CrygaP04345 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrygaP04345 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrygaP04345 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrygaP04345 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrygaP04345 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CrygaP04345 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrygaP04345 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrygaP04345 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CrygaP04345 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CrygaP04345 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrygaP04345 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrygaP04345 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CrygaP04345 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CrygaP04345 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CrygaP04345 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CrygaP04345 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CrygaP04345 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CrygaP04345 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CrygaP04345 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CrygaP04345 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CrygaP04345 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CrygaP04345 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CrygaP04345 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CrygaP04345 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CrygaP04345 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CrygaP04345 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CrygaP04345 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CrygaP04345 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CrygaP04345 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CrygaP04345 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CrygaP04345 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CrygaP04345 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CrygaP04345 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CrygaP04345 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CrygaP04345 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrygaP04345 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CrygaP04345 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrygaP04345 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CrygaP04345 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CrygaP04345 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrygaP04345 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrygaP04345 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrygaP04345 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CrygaP04345 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrygaP04345 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CrygaP04345 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CrygaP04345 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CrygaP04345 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CrygaP04345 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CrygaP04345 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrygaP04345 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CrygaP04345 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CrygaP04345 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CrygaP04345 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CrygaP04345 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CrygaP04345 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CrygaP04345 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CrygaP04345 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CrygaP04345 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CrygaP04345 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CrygaP04345 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CrygaP04345 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CrygaP04345 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CrygaP04345 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CrygaP04345 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CrygaP04345 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CrygaP04345 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CrygaP04345 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CrygaP04345 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CrygaP04345 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CrygaP04345 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CrygaP04345 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CrygaP04345 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CrygaP04345 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CrygaP04345 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrygaP04345 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CrygaP04345 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CrygaP04345 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CrygaP04345 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CrygaP04345 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CrygaP04345 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CrygaP04345 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CrygaP04345 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CrygaP04345 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CrygaP04345 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CrygaP04345 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrygaP04345 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CrygaP04345 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CrygaP04345 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CrygaP04345 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CrygaP04345 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CrygaP04345 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CrygaP04345 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CrygaP04345 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CrygaP04345 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CrygaP04345 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CrygaP04345 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CrygaP04345 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CrygaP04345 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms