Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24,46■■□□□ 1,51
Krtap11-1E9Q2E9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Krtap11-1E9Q2E9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Krtap11-1E9Q2E9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Krtap11-1E9Q2E9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,28■■□□□ 1,16
Krtap11-1E9Q2E9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,74■■□□□ 1,07
Krtap11-1E9Q2E9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21,49■■□□□ 1,03
Krtap11-1E9Q2E9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21,34■■□□□ 1,01
Krtap11-1E9Q2E9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Krtap11-1E9Q2E9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21,04■□□□□ 0,96
Krtap11-1E9Q2E9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20,98■□□□□ 0,95
Krtap11-1E9Q2E9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Krtap11-1E9Q2E9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Krtap11-1E9Q2E9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Krtap11-1E9Q2E9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Krtap11-1E9Q2E9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Krtap11-1E9Q2E9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Krtap11-1E9Q2E9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Krtap11-1E9Q2E9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,87
Krtap11-1E9Q2E9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Krtap11-1E9Q2E9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20,45■□□□□ 0,86
Krtap11-1E9Q2E9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20,41■□□□□ 0,86
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Krtap11-1E9Q2E9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Krtap11-1E9Q2E9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Krtap11-1E9Q2E9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Krtap11-1E9Q2E9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Krtap11-1E9Q2E9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20,2■□□□□ 0,82
Krtap11-1E9Q2E9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Krtap11-1E9Q2E9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Krtap11-1E9Q2E9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Krtap11-1E9Q2E9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Krtap11-1E9Q2E9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19,96■□□□□ 0,79
Krtap11-1E9Q2E9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19,95■□□□□ 0,78
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Krtap11-1E9Q2E9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19,81■□□□□ 0,76
Krtap11-1E9Q2E9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19,73■□□□□ 0,75
Krtap11-1E9Q2E9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19,67■□□□□ 0,74
Krtap11-1E9Q2E9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19,65■□□□□ 0,74
Krtap11-1E9Q2E9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Krtap11-1E9Q2E9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Krtap11-1E9Q2E9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Krtap11-1E9Q2E9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19,45■□□□□ 0,7
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Krtap11-1E9Q2E9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,32■□□□□ 0,68
Krtap11-1E9Q2E9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
Krtap11-1E9Q2E9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Krtap11-1E9Q2E9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19,26■□□□□ 0,67
Krtap11-1E9Q2E9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19,23■□□□□ 0,67
Krtap11-1E9Q2E9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
Krtap11-1E9Q2E9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19,21■□□□□ 0,67
Krtap11-1E9Q2E9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Krtap11-1E9Q2E9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19,19■□□□□ 0,66
Krtap11-1E9Q2E9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,18■□□□□ 0,66
Krtap11-1E9Q2E9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,18■□□□□ 0,66
Krtap11-1E9Q2E9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
Krtap11-1E9Q2E9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19,15■□□□□ 0,66
Krtap11-1E9Q2E9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19,11■□□□□ 0,65
Krtap11-1E9Q2E9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19,1■□□□□ 0,65
Krtap11-1E9Q2E9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Krtap11-1E9Q2E9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19,07■□□□□ 0,64
Krtap11-1E9Q2E9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Krtap11-1E9Q2E9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18,95■□□□□ 0,62
Krtap11-1E9Q2E9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Krtap11-1E9Q2E9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Krtap11-1E9Q2E9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,89■□□□□ 0,61
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Krtap11-1E9Q2E9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Krtap11-1E9Q2E9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
Krtap11-1E9Q2E9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,61
Krtap11-1E9Q2E9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
Krtap11-1E9Q2E9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Krtap11-1E9Q2E9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Krtap11-1E9Q2E9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Krtap11-1E9Q2E9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18,78■□□□□ 0,6
Krtap11-1E9Q2E9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Krtap11-1E9Q2E9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Krtap11-1E9Q2E9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Krtap11-1E9Q2E9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Krtap11-1E9Q2E9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18,71■□□□□ 0,59
Krtap11-1E9Q2E9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,69■□□□□ 0,58
Krtap11-1E9Q2E9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
Krtap11-1E9Q2E9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18,66■□□□□ 0,58
Krtap11-1E9Q2E9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18,65■□□□□ 0,58
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,65■□□□□ 0,58
Krtap11-1E9Q2E9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms