RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Col7a1Q63870 2944 aa6.57□□□□□ -1.36
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dmbt1Q60997 2085 aa6.56□□□□□ -1.36
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 H2al1kJ3QP08 105 aa6.56□□□□□ -1.36
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm5629P06327 117 aa6.56□□□□□ -1.36
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 H2al1eQ810S6 105 aa6.56□□□□□ -1.36
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 H2al1mQ9DAD9 105 aa6.56□□□□□ -1.36
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 4930564D02RikQ9D4S4 103 aa6.55□□□□□ -1.36
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Glrp1E9Q9S8 174 aa6.54□□□□□ -1.36
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Itpr2Q9Z329 2701 aa6.54□□□□□ -1.36
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trav4-3A0A0B4J1K1 110 aa6.54□□□□□ -1.36
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm10300Q8C8P7 189 aa6.54□□□□□ -1.36
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Csmd1Q923L3 3564 aa6.53□□□□□ -1.36
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gp9O88186 177 aa6.53□□□□□ -1.36
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pou2af1Q64693 256 aa6.52□□□□□ -1.37
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tm2d2Q8R0I4 213 aa6.51□□□□□ -1.37
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 FcgbpE9Q0B5 2583 aa6.51□□□□□ -1.37
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem223Q9CQE2 199 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trav13-2A0A075B649 110 aa6.5□□□□□ -1.37
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 TshbP12656 138 aa6.5□□□□□ -1.37
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gphb5Q812B2 130 aa6.5□□□□□ -1.37
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rpl28P41105 137 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Timm17aQ9Z0V8 171 aa6.46□□□□□ -1.38
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Rprd1b-201ENSMUST00000029180 4930442H23RikQ9D5G7 103 aa6.45□□□□□ -1.38
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