Protein–RNA interactions for Protein: P35230

Reg3b, Regenerating islet-derived protein 3-beta, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg3bP35230 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Reg3bP35230 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Reg3bP35230 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Reg3bP35230 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Reg3bP35230 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Reg3bP35230 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,46■■□□□ 1,19
Reg3bP35230 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,24■■□□□ 1,15
Reg3bP35230 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21,94■■□□□ 1,1
Reg3bP35230 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21,89■■□□□ 1,09
Reg3bP35230 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Reg3bP35230 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Reg3bP35230 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Reg3bP35230 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Reg3bP35230 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,31■■□□□ 1
Reg3bP35230 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21,25■□□□□ 0,99
Reg3bP35230 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21,25■□□□□ 0,99
Reg3bP35230 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Reg3bP35230 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Reg3bP35230 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Reg3bP35230 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Reg3bP35230 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Reg3bP35230 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Reg3bP35230 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Reg3bP35230 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Reg3bP35230 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Reg3bP35230 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Reg3bP35230 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20,69■□□□□ 0,9
Reg3bP35230 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Reg3bP35230 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Reg3bP35230 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20,64■□□□□ 0,89
Reg3bP35230 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Reg3bP35230 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Reg3bP35230 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Reg3bP35230 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Reg3bP35230 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20,26■□□□□ 0,83
Reg3bP35230 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,15■□□□□ 0,82
Reg3bP35230 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Reg3bP35230 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,11■□□□□ 0,81
Reg3bP35230 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Reg3bP35230 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Reg3bP35230 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Reg3bP35230 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Reg3bP35230 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Reg3bP35230 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0,79
Reg3bP35230 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19,95■□□□□ 0,78
Reg3bP35230 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Reg3bP35230 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Reg3bP35230 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Reg3bP35230 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19,88■□□□□ 0,77
Reg3bP35230 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Reg3bP35230 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Reg3bP35230 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19,82■□□□□ 0,76
Reg3bP35230 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Reg3bP35230 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Reg3bP35230 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19,77■□□□□ 0,76
Reg3bP35230 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Reg3bP35230 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19,69■□□□□ 0,74
Reg3bP35230 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
Reg3bP35230 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Reg3bP35230 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19,67■□□□□ 0,74
Reg3bP35230 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19,62■□□□□ 0,73
Reg3bP35230 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19,62■□□□□ 0,73
Reg3bP35230 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Reg3bP35230 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Reg3bP35230 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Reg3bP35230 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,56■□□□□ 0,72
Reg3bP35230 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,51■□□□□ 0,71
Reg3bP35230 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19,51■□□□□ 0,71
Reg3bP35230 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Reg3bP35230 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19,47■□□□□ 0,71
Reg3bP35230 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
Reg3bP35230 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
Reg3bP35230 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
Reg3bP35230 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19,44■□□□□ 0,7
Reg3bP35230 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Reg3bP35230 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,42■□□□□ 0,7
Reg3bP35230 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19,41■□□□□ 0,7
Reg3bP35230 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19,33■□□□□ 0,68
Reg3bP35230 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19,29■□□□□ 0,68
Reg3bP35230 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,29■□□□□ 0,68
Reg3bP35230 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,25■□□□□ 0,67
Reg3bP35230 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
Reg3bP35230 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19,24■□□□□ 0,67
Reg3bP35230 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19,22■□□□□ 0,67
Reg3bP35230 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19,21■□□□□ 0,67
Reg3bP35230 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
Reg3bP35230 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19,14■□□□□ 0,65
Reg3bP35230 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
Reg3bP35230 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
Reg3bP35230 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19,08■□□□□ 0,64
Reg3bP35230 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Reg3bP35230 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Reg3bP35230 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,63
Reg3bP35230 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Reg3bP35230 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18,98■□□□□ 0,63
Reg3bP35230 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Reg3bP35230 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18,97■□□□□ 0,63
Reg3bP35230 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18,95■□□□□ 0,62
Reg3bP35230 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18,93■□□□□ 0,62
Reg3bP35230 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms