Protein–RNA interactions for Protein: Q812B2

Gphb5, Glycoprotein hormone beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gphb5Q812B2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Gphb5Q812B2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gphb5Q812B2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gphb5Q812B2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gphb5Q812B2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gphb5Q812B2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gphb5Q812B2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gphb5Q812B2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gphb5Q812B2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gphb5Q812B2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gphb5Q812B2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gphb5Q812B2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gphb5Q812B2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gphb5Q812B2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gphb5Q812B2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gphb5Q812B2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gphb5Q812B2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gphb5Q812B2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gphb5Q812B2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gphb5Q812B2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gphb5Q812B2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gphb5Q812B2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gphb5Q812B2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gphb5Q812B2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gphb5Q812B2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gphb5Q812B2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gphb5Q812B2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gphb5Q812B2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gphb5Q812B2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gphb5Q812B2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gphb5Q812B2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gphb5Q812B2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gphb5Q812B2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gphb5Q812B2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gphb5Q812B2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gphb5Q812B2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gphb5Q812B2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gphb5Q812B2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gphb5Q812B2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gphb5Q812B2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gphb5Q812B2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gphb5Q812B2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gphb5Q812B2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gphb5Q812B2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gphb5Q812B2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gphb5Q812B2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gphb5Q812B2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gphb5Q812B2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gphb5Q812B2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gphb5Q812B2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gphb5Q812B2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gphb5Q812B2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gphb5Q812B2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gphb5Q812B2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gphb5Q812B2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gphb5Q812B2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gphb5Q812B2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gphb5Q812B2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gphb5Q812B2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gphb5Q812B2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gphb5Q812B2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gphb5Q812B2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gphb5Q812B2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gphb5Q812B2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gphb5Q812B2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gphb5Q812B2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gphb5Q812B2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gphb5Q812B2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gphb5Q812B2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gphb5Q812B2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gphb5Q812B2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gphb5Q812B2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gphb5Q812B2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gphb5Q812B2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Gphb5Q812B2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gphb5Q812B2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gphb5Q812B2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gphb5Q812B2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gphb5Q812B2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gphb5Q812B2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gphb5Q812B2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gphb5Q812B2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gphb5Q812B2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gphb5Q812B2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gphb5Q812B2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gphb5Q812B2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gphb5Q812B2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gphb5Q812B2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gphb5Q812B2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gphb5Q812B2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gphb5Q812B2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gphb5Q812B2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gphb5Q812B2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gphb5Q812B2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gphb5Q812B2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gphb5Q812B2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gphb5Q812B2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gphb5Q812B2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gphb5Q812B2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gphb5Q812B2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms