RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000170957.2

Ggps1-201, Transcript of Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ggps1, Length 4,244 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1-201ENSMUST00000170957 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gm20499D3Z4G5 72 aa7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 P01674 108 aa7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 AW146154Q3TPQ7 468 aa7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Col6a5A6H584 2640 aa7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Lcn2P11672 200 aa7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gm12689Q8BQU9 117 aa7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gm5468Q8C3D3 155 aa7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Odf3Q920N1 254 aa7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Mrpl20Q9CQL4 149 aa7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 TcraP01849 138 aa7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Sumo2P61957 95 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Megf10Q6DIB5 1147 aa7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 SpenQ62504 3644 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Tcrg-C1A0A075B5Z0 172 aa7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Trav14-3A0A075B607 120 aa7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Scgb1b3J3QJY4 93 aa7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Tcrg-C3L7N479 172 aa7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 P01791 123 aa7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Tmem14cQ9CQN6 114 aa7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gtsf1lQ9CWD0 151 aa7.19□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Tcl1b4P56844 120 aa7.18□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 H2al1nQ497L1 109 aa7.18□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 PpbpQ9EQI5 113 aa7.18□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 4930596D02RikQ3V0H9 216 aa7.18□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Rnf183Q8QZS5 190 aa7.18□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Prelid3aQ8VE85 172 aa7.18□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Higd1aQ9JLR9 95 aa7.18□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Chd9Q8BYH8 2885 aa7.18□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Trbv14A0A140T8L9 115 aa7.18□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Sslp1Q3UN54 99 aa7.18□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 9130213A22RikQ3V3T2 120 aa7.17□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Ndufb4Q9CQC7 129 aa7.17□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Hivep1Q03172 2688 aa7.17□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Nat8b-psE0CYC6 232 aa7.17□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 1810032O08RikE9PZV8 113 aa7.17□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 GfyJ3KML8 504 aa7.17□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 S100a8P27005 89 aa7.17□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Ndufa4Q62425 82 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Tex48Q9DA81 110 aa7.17□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Tdgf1P51865 171 aa7.17□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gpx7Q99LJ6 186 aa7.17□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Trdv2-1A0A0G2JGB9 116 aa7.16□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gm9767G3X930 207 aa7.16□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 CirbpP60824 172 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Atxn7l1Q9CZ05 146 aa7.16□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Ebi3O35228 228 aa7.16□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gphb5Q812B2 130 aa7.16□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 A130051J06RikQ8CAU1 227 aa7.16□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Srsf9Q9D0B0 222 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Trav14n-2A0A0G2JDF5 121 aa7.16□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Olfr1367Q8VFG2 316 aa7.16□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Ighv1-49A0A0A6YWX2 117 aa7.16□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Aqp7O54794 303 aa7.16□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Defa9P50707 93 aa7.16□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Dkk2Q9QYZ8 259 aa7.16□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Ighv1-82A0A0G2JEU7 117 aa7.15□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gm8439G3UWA7 96 aa7.15□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 FshbQ60687 130 aa7.15□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 P01753 117 aa7.15□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gata3P23772 443 aa7.15□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Q9D727 114 aa7.15□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Lama5Q61001 3718 aa7.15□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Esm1Q9QYY7 184 aa7.15□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Defa37K9J724 93 aa7.14□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Defa5P28312 93 aa7.14□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Trav3-3Q5R1C3 114 aa7.14□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Fam222aQ6PGH4 453 aa7.14□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Trav12d-3A0A075B6A4 115 aa7.14□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Trav9n-2A0A0G2JDP3 113 aa7.14□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Esp4A8R0T8 117 aa7.14□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 7420426K07RikQ3UX66 186 aa7.14□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gm11733Q8BQP1 125 aa7.14□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 TroQ6DIC6 2087 aa7.14□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gm3233E9Q2H5 230 aa7.14□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 March3Q8BRX9 218 aa7.14□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Defa22Q8C1N8 93 aa7.14□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gm933J3QPC1 141 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Psmb8P28063 276 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Cops9Q3U898 57 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 B430305J03RikQ8BQQ8 176 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Arhgap32Q811P8 2089 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Trbv13-1A0A0B4J1P8 112 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Omt2bD3YX29 119 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Sdhaf1Q3U276 118 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Zmat4Q8BZ94 229 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Rasl10aQ8K5A4 203 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Tmem263Q9DAM7 115 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Fam216aQ9DB54 251 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Igsf10Q3V1M1 2594 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Trav14-2A0A075B694 121 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Smim13E9Q942 88 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 P03985 172 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Dad1P61804 113 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Dand5Q76LW6 185 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Crlf1Q9JM58 425 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa7.13□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Mrps12O35680 139 aa7.12□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Cox8bP48772 70 aa7.12□□□□□ -1.27
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Mzt1Q8BUR9 78 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.2 ms