Protein–RNA interactions for Protein: P28063

Psmb8, Proteasome subunit beta type-8, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb8P28063 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Psmb8P28063 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psmb8P28063 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmb8P28063 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmb8P28063 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psmb8P28063 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmb8P28063 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmb8P28063 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmb8P28063 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmb8P28063 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmb8P28063 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmb8P28063 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmb8P28063 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmb8P28063 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmb8P28063 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmb8P28063 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmb8P28063 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmb8P28063 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmb8P28063 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmb8P28063 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmb8P28063 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmb8P28063 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmb8P28063 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmb8P28063 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmb8P28063 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmb8P28063 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmb8P28063 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmb8P28063 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmb8P28063 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmb8P28063 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmb8P28063 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmb8P28063 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmb8P28063 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmb8P28063 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmb8P28063 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmb8P28063 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmb8P28063 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmb8P28063 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmb8P28063 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmb8P28063 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmb8P28063 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmb8P28063 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmb8P28063 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmb8P28063 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmb8P28063 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmb8P28063 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmb8P28063 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmb8P28063 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmb8P28063 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmb8P28063 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmb8P28063 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmb8P28063 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmb8P28063 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmb8P28063 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmb8P28063 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmb8P28063 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmb8P28063 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmb8P28063 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmb8P28063 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmb8P28063 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmb8P28063 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psmb8P28063 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psmb8P28063 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psmb8P28063 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb8P28063 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb8P28063 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb8P28063 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb8P28063 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb8P28063 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb8P28063 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb8P28063 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb8P28063 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb8P28063 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb8P28063 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmb8P28063 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmb8P28063 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmb8P28063 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmb8P28063 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmb8P28063 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb8P28063 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb8P28063 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb8P28063 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb8P28063 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmb8P28063 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmb8P28063 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Psmb8P28063 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psmb8P28063 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psmb8P28063 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb8P28063 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb8P28063 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmb8P28063 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb8P28063 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb8P28063 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmb8P28063 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psmb8P28063 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmb8P28063 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmb8P28063 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb8P28063 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb8P28063 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psmb8P28063 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms