RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000079702.3

Cbx1-202, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Derl1Q99J56 251 aa8.39□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 2310061N02RikQ9D6S9 174 aa8.39□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pkd1O08852 4293 aa8.39□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dnah11E9Q7N9 4488 aa8.39□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trav6n-6A0A075B6B2 114 aa8.38□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm5741B2RVA4 72 aa8.38□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Htr1dQ61224 374 aa8.38□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ss18Q62280 418 aa8.38□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc25a48Q8BW66 306 aa8.38□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr480Q8VEZ0 312 aa8.38□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ighv8-11A0A075B5X4 119 aa8.37□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Igkv4-74A0A0B4J1I3 119 aa8.37□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr779E9PUS9 130 aa8.37□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Vmn1r149E9PWL6 307 aa8.37□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Krtap27-1E9PX37 202 aa8.37□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Vmn1r101E9Q365 307 aa8.37□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm10322F7D7I4 111 aa8.37□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ly6gP35461 111 aa8.37□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rpl19P84099 196 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr322Q5NCC8 327 aa8.37□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm5468Q8C3D3 155 aa8.37□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Klk15Q8CGR4 254 aa8.37□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mrpl36Q99N90 102 aa8.37□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ighv8-13A0A075B5Y0 101 aa8.36□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm45800A0A1B0GT24 152 aa8.36□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zfp931A2AHM2 298 aa8.36□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm20499D3Z4G5 72 aa8.36□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm16519F8VQK7 162 aa8.36□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm10509O88255 85 aa8.36□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 CtsgP28293 261 aa8.36□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr313Q5NC55 308 aa8.36□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Eif5a2Q8BGY2 153 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zfand2bQ91X58 257 aa8.36□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Stard9Q80TF6 4561 aa8.36□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trbv16A0A0B4J1H3 115 aa8.35□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm15056F6ZR08 88 aa8.35□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm21887J3QQ04 176 aa8.35□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 S100a4P07091 101 aa8.35□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rps20P60867 119 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cd84Q18PI6 329 aa8.35□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr830Q8VFJ5 315 aa8.35□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Atoh7Q9Z2E5 149 aa8.35□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 SacsQ9JLC8 4582 aa8.34□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trav6-6A0A075B603 114 aa8.34□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Foxi3E0CZH3 425 aa8.34□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ndufa4l2Q4FZG9 87 aa8.34□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ctf1Q60753 203 aa8.34□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Them7Q9DCP4 223 aa8.34□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 BlnkQ9QUN3 457 aa8.34□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Plekhb2Q9QZC7 221 aa8.34□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm15294V9GXA7 121 aa8.34□□□□□ -1.07
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fut1O09160 376 aa8.33□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sfrp2P97299 295 aa8.33□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 PrcdQ00LT2 53 aa8.33□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 C730034F03RikQ8BGL5 111 aa8.33□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 4930474N05RikQ8BVR5 218 aa8.33□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cysltr1Q99JA4 352 aa8.33□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pradc1Q9D9N8 188 aa8.33□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Kcnip3Q9QXT8 256 aa8.33□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ube2l6Q9QZU9 153 aa8.33□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Prss1Q9Z1R9 246 aa8.33□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dync1h1Q9JHU4 4644 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 H2al2bA9Z055 111 aa8.32□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Spink4O35679 86 aa8.32□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 TshbP12656 138 aa8.32□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr1537P34983 314 aa8.32□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gng7Q61016 68 aa8.32□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Oraov1Q8CH62 137 aa8.32□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 GgctQ9D7X8 188 aa8.32□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trav9d-3A0A075B695 113 aa8.31□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Lcn2P11672 200 aa8.31□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trp53rkaQ5U452 244 aa8.31□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tp53rkQ99PW4 244 aa8.31□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gtsf1lQ9CWD0 151 aa8.31□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 ChtopQ9CY57 249 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr1320A2AHM8 319 aa8.3□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rhox4gQ2MDF7 205 aa8.3□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 NpbQ8K4P1 119 aa8.3□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gkn1Q9CR36 201 aa8.3□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tppp3Q9CRB6 176 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dnah5Q8VHE6 4621 aa8.29□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ighv1-66A0A075B5X5 117 aa8.29□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ins1P01325 108 aa8.29□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sub1P11031 127 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Edn1P22387 202 aa8.29□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cacng7P62956 275 aa8.29□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 1500011B03RikQ3TTH7 73 aa8.29□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Smim15Q3UTD9 74 aa8.29□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Khdc1aQ3UWR2 166 aa8.29□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc17a2Q5SZA1 478 aa8.29□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Snx22Q8C084 192 aa8.29□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Med28Q920D3 178 aa8.29□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ndufs7Q9DC70 224 aa8.29□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tcf24V9GWT9 166 aa8.29□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nkx6-2D3Z4R4 277 aa8.28□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm17732E9Q5I2 61 aa8.28□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cox7a1P56392 80 aa8.28□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 7420426K07RikQ3UX66 186 aa8.28□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rhox4eQ504P9 205 aa8.28□□□□□ -1.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Vmo1Q5SXG7 201 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 62.3 ms