Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ctf1Q60753 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Ctf1Q60753 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ctf1Q60753 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Ctf1Q60753 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
Ctf1Q60753 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ctf1Q60753 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Ctf1Q60753 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Ctf1Q60753 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Ctf1Q60753 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ctf1Q60753 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ctf1Q60753 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ctf1Q60753 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ctf1Q60753 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ctf1Q60753 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ctf1Q60753 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ctf1Q60753 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ctf1Q60753 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ctf1Q60753 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ctf1Q60753 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Ctf1Q60753 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
Ctf1Q60753 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Ctf1Q60753 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
Ctf1Q60753 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Ctf1Q60753 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Ctf1Q60753 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Ctf1Q60753 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Ctf1Q60753 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Ctf1Q60753 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Ctf1Q60753 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Ctf1Q60753 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Ctf1Q60753 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Ctf1Q60753 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Ctf1Q60753 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Ctf1Q60753 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Ctf1Q60753 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Ctf1Q60753 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Ctf1Q60753 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,89■■□□□ 1,41
Ctf1Q60753 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Ctf1Q60753 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,81■■□□□ 1,4
Ctf1Q60753 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ctf1Q60753 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ctf1Q60753 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ctf1Q60753 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Ctf1Q60753 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ctf1Q60753 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Ctf1Q60753 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ctf1Q60753 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ctf1Q60753 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,62■■□□□ 1,37
Ctf1Q60753 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ctf1Q60753 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Ctf1Q60753 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Ctf1Q60753 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Ctf1Q60753 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Ctf1Q60753 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Ctf1Q60753 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Ctf1Q60753 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Ctf1Q60753 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Ctf1Q60753 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Ctf1Q60753 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Ctf1Q60753 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Ctf1Q60753 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Ctf1Q60753 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Ctf1Q60753 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ctf1Q60753 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,13■■□□□ 1,29
Ctf1Q60753 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Ctf1Q60753 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ctf1Q60753 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ctf1Q60753 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ctf1Q60753 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ctf1Q60753 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,27
Ctf1Q60753 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,95■■□□□ 1,27
Ctf1Q60753 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ctf1Q60753 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ctf1Q60753 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ctf1Q60753 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ctf1Q60753 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Ctf1Q60753 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ctf1Q60753 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ctf1Q60753 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ctf1Q60753 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Ctf1Q60753 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Ctf1Q60753 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Ctf1Q60753 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
Ctf1Q60753 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Ctf1Q60753 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,82■■□□□ 1,24
Ctf1Q60753 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,78■■□□□ 1,24
Ctf1Q60753 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Ctf1Q60753 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,78■■□□□ 1,24
Ctf1Q60753 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ctf1Q60753 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ctf1Q60753 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Ctf1Q60753 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ctf1Q60753 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Ctf1Q60753 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,7■■□□□ 1,22
Ctf1Q60753 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,67■■□□□ 1,22
Ctf1Q60753 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Ctf1Q60753 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Ctf1Q60753 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Ctf1Q60753 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms